RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 TYMSP04818 313 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 S100A6P06703 90 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 CT45A10P0DMU9 189 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 CRISP2P16562 243 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 Q5VSD8 79 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 SGK494Q96LW2 274 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 A0A0J9YX75 114 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 A8MWL6 223 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 P01737 135 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF688P0C7X2 276 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 CRIP1P50238 77 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 TSKUQ8WUA8 353 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 XCL2Q9UBD3 114 aa6.57□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 C5orf52A6NGY3 159 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 KLLNB2CW77 178 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 S100A8P05109 93 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 CXCL1P09341 107 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 ERCC8Q13216 396 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 COX19Q49B96 90 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 PSMG4Q5JS54 123 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 Q6AWC8 147 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 RASL11AQ6T310 242 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 Q8TAT8 98 aa6.56□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 XKRY2A2RUG3 117 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 HLA-DRB4P13762 266 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 CCL18P55774 89 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 LINC01559Q495D7 138 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 PRR27Q6MZM9 219 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 C8orf49Q96NF6 230 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 NAT8BQ9UHF3 227 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.55□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.55□□□□□ -1.36
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SMAD3-215ENST00000560424 SH2D1AO60880 128 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 AKR1D1P51857 326 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 KRTAP10-2P60368 255 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 DAD1P61803 113 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 TTC32Q5I0X7 151 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.54□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 NEU1Q99519 415 aa6.54□□□□□ -1.36
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SMAD3-215ENST00000560424 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PPQ1 181 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 F6UB75 175 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 H3BMM0 161 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 NUDT3O95989 172 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 TSPOP30536 169 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 LEPP41159 167 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 AMTNQ6UX39 209 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 ZFP82Q8N141 532 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 SYT8Q8NBV8 401 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 CNFNQ9BYD5 112 aa6.53□□□□□ -1.36
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1B0GW15 77 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 HIGD1CA8MV81 97 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 FAM229AH3BQW9 127 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 EREGO14944 169 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 CDKN1BP46527 198 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 S100A12P80511 92 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 TDRG1Q3Y452 100 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 DNLZQ5SXM8 178 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 NUP35Q8NFH5 326 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 GTSF1Q8WW33 167 aa6.52□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 MYCBP2O75592 4640 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1B0GXF2 115 aa6.51□□□□□ -1.37
SMAD3-215ENST00000560424 PHOX2AO14813 284 aa6.51□□□□□ -1.37
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