RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560246.1

FAM227B-210, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene FAM227B, Length 911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-210ENST00000560246 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa9.51□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 TRAV4A0A0B4J268 109 aa9.5□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 HIST1H2BAQ96A08 127 aa9.5□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.49□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 UMAD1C9J7I0 102 aa9.49□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 PAGE4O60829 102 aa9.49□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 ORM1P02763 201 aa9.49□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 SRIP30626 198 aa9.49□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 AKR1C3P42330 323 aa9.49□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 ZNF876PQ49A33 203 aa9.49□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 Q86TA4 180 aa9.49□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.49□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.48□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 GYPEP15421 78 aa9.48□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 LINC00315P59091 139 aa9.48□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 FMC1Q96HJ9 113 aa9.48□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.47□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 FAT1Q14517 4588 aa9.46□□□□□ -0.89
FAM227B-210ENST00000560246 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.46□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.46□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 B4DEV8 164 aa9.46□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 K7EQD1 137 aa9.46□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 M0R036 132 aa9.46□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 SIVA1O15304 175 aa9.46□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 NXPH4O95158 308 aa9.46□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 ASIPP42127 132 aa9.46□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.46□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 NHLRC2Q8NBF2 726 aa9.46□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.46□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 ZFP30Q9Y2G7 519 aa9.46□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 PGPEP1LA6NFU8 196 aa9.45□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.45□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.45□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa9.45□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 C9orf85Q96MD7 179 aa9.45□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.45□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.45□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 HERC1Q15751 4861 aa9.44□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.44□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.44□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.44□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 GRIFINA4D1Z8 144 aa9.44□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 RS1O15537 224 aa9.44□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 SH2D1AO60880 128 aa9.44□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.44□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.43□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 TEX46H3BTG2 121 aa9.43□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 H3BVH4 76 aa9.43□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.43□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.43□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.43□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.43□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 CRIP1P50238 77 aa9.42□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 Q6ZNX1 250 aa9.42□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 SYT8Q8NBV8 401 aa9.42□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 GNG13Q9P2W3 67 aa9.42□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 EPM2AB3EWF7 344 aa9.41□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 KRBOX1C9JBD0 128 aa9.41□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 CIDEAO60543 219 aa9.41□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 LTAP01374 205 aa9.41□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 C1QBP02746 253 aa9.41□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 S100A9P06702 114 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 RAB5CP51148 216 aa9.41□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 XGP55808 180 aa9.41□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 RHOHQ15669 191 aa9.41□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 AKAP14Q86UN6 197 aa9.41□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.41□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.41□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.4□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa9.4□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 A8MWV9 139 aa9.4□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 ARMS2P0C7Q2 107 aa9.4□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.4□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 PRR27Q6MZM9 219 aa9.4□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.4□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 BAGE2Q86Y30 109 aa9.4□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 MANBALQ9NQG1 85 aa9.4□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 IL36BQ9NZH7 164 aa9.4□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.4□□□□□ -0.9
FAM227B-210ENST00000560246 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
FAM227B-210ENST00000560246 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.39□□□□□ -0.91
FAM227B-210ENST00000560246 M0R381 172 aa9.39□□□□□ -0.91
FAM227B-210ENST00000560246 MGST1P10620 155 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
FAM227B-210ENST00000560246 CCL20P78556 96 aa9.39□□□□□ -0.91
FAM227B-210ENST00000560246 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.39□□□□□ -0.91
FAM227B-210ENST00000560246 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.39□□□□□ -0.91
FAM227B-210ENST00000560246 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.39□□□□□ -0.91
FAM227B-210ENST00000560246 PTH2Q96A98 100 aa9.39□□□□□ -0.91
FAM227B-210ENST00000560246 A0A087WTM6 91 aa9.38□□□□□ -0.91
FAM227B-210ENST00000560246 IFNA1P01562 189 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms