RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF492Q9P255 531 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 P0DMU3 169 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 FAM231AP0DMU4 169 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 FAM231CP0DMU5 169 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 WDR83OSQ9Y284 106 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 PLXNA2O75051 1894 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf70A6NJV1 201 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB112Q30KQ8 113 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 M0R381 172 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 FAM222AQ5U5X8 452 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00336Q6ZUF6 198 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 LYPD1Q8N2G4 141 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 RASL10AQ92737 203 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV12-3P01733 135 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
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PTPRB-210ENST00000551525 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 LYPD2Q6UXB3 125 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 MP68P56378 58 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 TOMM6Q96B49 74 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 K7EM74 188 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 BLCAPP62952 87 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 HS3ST6Q96QI5 342 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 C15orf65H3BRN8 121 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 CCL24O00175 119 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 Q6P435 159 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF876PQ49A33 203 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 ROS1P08922 2347 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 A6NED7 52 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 PROP1O75360 226 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV3-20P01619 116 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 HAMPP81172 84 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-23P01764 117 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf52Q96A22 123 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 POLEQ07864 2286 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 K7EMI3 77 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 AKAP6Q13023 2319 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 DYNAPQ8N1N2 210 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 PDE6HQ13956 83 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 ICOSQ9Y6W8 199 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 MED12Q93074 2177 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 ARTNQ5T4W7 220 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZQT7 251 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 F8VRH5 84 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 IGF1P05019 195 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 GFI1Q99684 422 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 MYO7BQ6PIF6 2116 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 COX7A2LO14548 114 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 ATP6V0E1O15342 81 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 NCOR2Q9Y618 2525 aa4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 LY6HO94772 140 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 ERCC8Q13216 396 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 MIR17HGQ75NE6 70 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 NOTCH4Q99466 2003 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087WWL8 130 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 FXYD5Q96DB9 178 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 U3KQK5 164 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 Q9UF83 564 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 PCNX2A6NKB5 2137 aa4.89□□□□□ -1.63
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