RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 Q71RC1 249 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 CGB7P0DN87 165 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 CARD19Q96LW7 228 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 SELENOKQ9Y6D0 94 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 SPRNQ5BIV9 151 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 PRO0255Q9UI72 69 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.54□□□□□ -1.36
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PTPRB-208ENST00000550358 C17orf77Q96MU5 243 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 IGLL1P15814 213 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 Q9H8V8 135 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRB-208ENST00000550358 C12orf74Q32Q52 190 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-208ENST00000550358 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-208ENST00000550358 BLCAPP62952 87 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRB-208ENST00000550358 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 XCL1P47992 114 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRB-208ENST00000550358 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.52□□□□□ -1.37
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PTPRB-208ENST00000550358 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
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PTPRB-208ENST00000550358 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRB-208ENST00000550358 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRB-208ENST00000550358 Q8N1Y9 231 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRB-208ENST00000550358 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 F6UB75 175 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 C10orf142B7Z368 130 aa6.51□□□□□ -1.37
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PTPRB-208ENST00000550358 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRB-208ENST00000550358 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.5□□□□□ -1.37
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PTPRB-208ENST00000550358 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZQT7 251 aa6.49□□□□□ -1.37
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF580Q9UK33 172 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRB-208ENST00000550358 DOCK8Q8NF50 2099 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 H3BT86 120 aa6.48□□□□□ -1.37
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PTPRB-208ENST00000550358 DIRC1Q969H9 104 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRB-208ENST00000550358 CCDC140Q96MF4 163 aa6.48□□□□□ -1.37
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