RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549306.1

HECTD4-210, Transcript of HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 2

Gene HECTD4, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM155Q4W5P6 130 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 MPV17L2Q567V2 206 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 SPRNQ5BIV9 151 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 DPPA3Q6W0C5 159 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 TCF23Q7RTU1 214 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 COX8CQ7Z4L0 72 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 PCP2Q8IVA1 136 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF645Q8N7E2 425 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 VSTM2AQ8TAG5 236 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 LINC01560Q8TB33 94 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 FAM19A4Q96LR4 140 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 C2orf50Q96LR7 162 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 ST20Q9HBF5 79 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 NRN1Q9NPD7 142 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 OTORQ9NRC9 128 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 KCNIP2Q9NS61 270 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 CALYQ9NYX4 217 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 CHD6Q8TD26 2715 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 DSCAMO60469 2012 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 USF3Q68DE3 2245 aa2.44□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 DSCAML1Q8TD84 2053 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 NUPR1O60356 82 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 DPM2O94777 84 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 NDUFC2O95298 119 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 IGHG2P01859 326 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 VDAC1P21796 283 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 SAA4P35542 130 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 ZNF137PP52743 207 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 FXYD4P59646 89 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 GNB2P62879 340 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 C17orf58Q2M2W7 97 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 NMSQ5H8A3 153 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 TTC32Q5I0X7 151 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 FAM120AOSQ5T036 256 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 Q6ZRU5 148 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 Q6ZVQ6 151 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 LINC00311Q8N616 119 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 DRAM1Q8N682 238 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 FAM216BQ8N7L0 139 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 ZNRF1Q8ND25 227 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 OR10AG1Q8NH19 301 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 IL1F10Q8WWZ1 152 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 AP1S3Q96PC3 154 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM147Q9BVK8 224 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 CCL28Q9NRJ3 127 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 COMMD9Q9P000 198 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 SPCS1Q9Y6A9 102 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 COL12A1Q99715 3063 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 DYSFO75923 2080 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 PTPN13Q12923 2485 aa2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 CREBBPQ92793 2442 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 A0A1B0GXF2 115 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 A0A1W2PPM0 123 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 UMAD1C9J7I0 102 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM262E9PQX1 116 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 F8W1H4 67 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 TMEM250H0YL14 139 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 H7C1H1 209 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 C19orf84I3L1E1 186 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 FCN1O00602 326 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 NDUFB3O43676 98 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 PITX3O75364 302 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 DEDDO75618 318 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 GYPAP02724 150 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 MT-ND6P03923 174 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 TFF1P04155 84 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 P0DMU3 169 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 FAM231AP0DMU4 169 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 FAM231CP0DMU5 169 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 BCL2P10415 239 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 PSMB8P28062 276 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 EDDM3BP56851 147 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 LINC00315P59091 139 aa2.42□□□□□ -2.02
HECTD4-210ENST00000549306 SEC11AP67812 179 aa2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms