RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546997.1

BRF1-208, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 1,999 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-208	ENST00000546997	TRGV3	P03979	118 aa		12.59	□□□□□ -0.39
BRF1-208	ENST00000546997	PCP2	Q8IVA1	136 aa		12.59	□□□□□ -0.39
BRF1-208	ENST00000546997	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		12.58	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	NMU	P48645	174 aa		12.58	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	CRIP1	P50238	77 aa		12.58	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	PDE6H	Q13956	83 aa		12.58	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		12.58	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		12.58	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	ATP6V0B	Q99437	205 aa		12.58	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	CCDC140	Q96MF4	163 aa		12.58	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	SCGB2A1	O75556	95 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	IGHG4	P01861	327 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	12.57	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997		H3BUA1	57 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	BRI3	O95415	125 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	PSMB8	P28062	276 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	C17orf77	Q96MU5	243 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	FAM223B	A6NKX1	122 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	ATP5L	O75964	103 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	GCSH	P23434	173 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	FCER1G	P30273	86 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	CEND1	Q8N111	149 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	RNF152	Q8N8N0	203 aa		12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	12.56	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	CKS2	P33552	79 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	RAB9A	P51151	201 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	FXYD2	P54710	66 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	ATP5G2	Q06055	141 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	AMN1	Q8IY45	258 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	MTURN	Q8N3F0	131 aa		12.55	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	LINC01619	G3V211	115 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV3-11	P01762	117 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	CLEC3B	P05452	202 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	DKK2	Q9UBU2	259 aa		12.54	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	IGKC	P01834	107 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	CNFN	Q9BYD5	112 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		12.53	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		12.52	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	IGLL5	B9A064	214 aa		12.52	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	TRBV12-3	P01733	135 aa		12.52	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.4
BRF1-208	ENST00000546997	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM213	A2RRL7	107 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	NPY	P01303	97 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	USMG5	Q96IX5	58 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		12.52	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	DPM2	O94777	84 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	IGLC6	P0CF74	106 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	TWIST1	Q15672	202 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	TPPP3	Q9BW30	176 aa		12.51	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	TMEM89	A2RUT3	159 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	SH2D1A	O60880	128 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	LINC01006	Q8NI28	216 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	ATR	Q13535	2644 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	ELANE	P08246	267 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	ZNF479	Q96JC4	524 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997		A0A1B0GWB2	263 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	C16orf95	Q9H693	158 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	C8orf49	Q96NF6	230 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997		M0R3E3	92 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	NDUFA7	O95182	113 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	LEP	P41159	167 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	WFDC2	Q14508	124 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	C12orf74	Q32Q52	190 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	GAGE13	Q4V321	117 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	MRAP2	Q96G30	205 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	RNF185	Q96GF1	192 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	PRSS1	P07477	247 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	ARL3	P36405	182 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997		Q8N8P6	123 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	C18orf15	Q96N68	181 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	PRR25	Q96S07	402 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		12.46	□□□□□ -0.41
BRF1-208	ENST00000546997	BUB3	O43684	328 aa		12.46	□□□□□ -0.41

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