RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 EDN2P20800 178 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-202ENST00000538886 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-202ENST00000538886 OR11H2Q8NH07 326 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-202ENST00000538886 VGLL1Q99990 258 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-202ENST00000538886 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-202ENST00000538886 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-202ENST00000538886 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-202ENST00000538886 PYYP10082 97 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-202ENST00000538886 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
GGA3-202ENST00000538886 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.72□□□□□ -1.33
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GGA3-202ENST00000538886 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.72□□□□□ -1.33
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GGA3-202ENST00000538886 ZNF747Q9BV97 191 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-202ENST00000538886 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-202ENST00000538886 H3BUA1 57 aa6.71□□□□□ -1.33
GGA3-202ENST00000538886 I3L2K1 104 aa6.71□□□□□ -1.33
GGA3-202ENST00000538886 K7EN84 100 aa6.71□□□□□ -1.33
GGA3-202ENST00000538886 INSL3P51460 131 aa6.71□□□□□ -1.33
GGA3-202ENST00000538886 C16orf95Q9H693 158 aa6.71□□□□□ -1.33
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GGA3-202ENST00000538886 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 GAGE12JA6NER3 117 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 GAGE7O76087 117 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 IGKV1-17P01599 117 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 APOHP02749 345 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 GAGE12FP0CL80 117 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 GAGE12GP0CL81 117 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 GAGE12IP0CL82 117 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 COX8AP10176 69 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 HTN3P15516 51 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 GAGE4Q13068 117 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 NDUFA4O00483 81 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 KRTAP10-3P60369 221 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 A8MWL6 223 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 M0QXV9 152 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 CD7P09564 240 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 RNF182Q8N6D2 247 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 V9GYV3 84 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 PGPA6NDG6 321 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 KNCNA6PVL3 124 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 IGLV1-40P01703 118 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 GCHFRP30047 84 aa6.7□□□□□ -1.34
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GGA3-202ENST00000538886 XCL2Q9UBD3 114 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 ERG28Q9UKR5 140 aa6.69□□□□□ -1.34
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GGA3-202ENST00000538886 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.69□□□□□ -1.34
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GGA3-202ENST00000538886 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 PGLYRP4Q96LB8 373 aa6.69□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 MPDU1O75352 247 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 TMEM189A5PLL7 270 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 C8orf88P0DMB2 117 aa6.68□□□□□ -1.34
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GGA3-202ENST00000538886 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 VCX2Q9H322 139 aa6.68□□□□□ -1.34
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GGA3-202ENST00000538886 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 F8W1H4 67 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 M0R3E3 92 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 PRELID3AQ96N28 172 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 TRGV9Q99603 122 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 CT45A10P0DMU9 189 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 GPR82Q96P67 336 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 SPATA25Q9BR10 227 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 TSPAN13O95857 204 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-202ENST00000538886 OSTCQ9NRP0 149 aa6.67□□□□□ -1.34
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