RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537757.5

LMO3-217, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 516 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-217ENST00000537757 EMP1P54849 157 aa8.8□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.8□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.8□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 TSKUQ8WUA8 353 aa8.8□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 GTSF1Q8WW33 167 aa8.8□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 C18orf15Q96N68 181 aa8.8□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 NDUFAF3Q9BU61 184 aa8.8□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.8□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 CELA1Q9UNI1 258 aa8.8□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 A0A1W2PPQ1 181 aa8.79□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 M0R2P5 195 aa8.79□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 PPP1R2P9O14990 202 aa8.79□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 NXPH4O95158 308 aa8.79□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 MT-ND4LP03901 98 aa8.79□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 GZMBP10144 247 aa8.79□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 RNF212Q495C1 297 aa8.79□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 WDR73Q6P4I2 378 aa8.79□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 CNFNQ9BYD5 112 aa8.79□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.78□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.78□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 CXorf65A6NEN9 183 aa8.78□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 F2Z2F3 143 aa8.78□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 H3BVH4 76 aa8.78□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 CTRLP40313 264 aa8.78□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 C12orf74Q32Q52 190 aa8.78□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 Q6ZTI0 123 aa8.78□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.78□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.78□□□□□ -1
LMO3-217ENST00000537757 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.77□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 ZNF876PQ49A33 203 aa8.77□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.77□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.77□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 CTDSP1Q9GZU7 261 aa8.77□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 TMEM242Q9NWH2 141 aa8.77□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 A0A087WWC5 75 aa8.76□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa8.76□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 APOC3P02656 99 aa8.76□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 RHEBQ15382 184 aa8.76□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.76□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.76□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 SVBPQ8N300 66 aa8.76□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.76□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.76□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 HIGD1CA8MV81 97 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 CACNG7P62955 275 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 ZFP82Q8N141 532 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 POM121L12Q8N7R1 296 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 NUP35Q8NFH5 326 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 IMMP2LQ96T52 175 aa8.75□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 GAGE12BA1L429 117 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 RS1O15537 224 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 GAGE7O76087 117 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 SNAPINO95295 136 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 GAGE12FP0CL80 117 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 GAGE12GP0CL81 117 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 GAGE12IP0CL82 117 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 DEFB130BP0DP73 79 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 DEFB130AP0DP74 79 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 DAD1P61803 113 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 SYT8Q8NBV8 401 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.74□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 Q6ZTC4 211 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 TPPP3Q9BW30 176 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 TENM2Q9NT68 2774 aa8.73□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 TRGV2A0A075B6R0 118 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 A8MWV9 139 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 M0R381 172 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 CIDEAO60543 219 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 CRYGDP07320 174 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 NTF3P20783 257 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 MUC4Q99102 2169 aa8.72□□□□□ -1.01
LMO3-217ENST00000537757 A0A1B0GUT8 65 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-217ENST00000537757 ATP5G1P05496 136 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-217ENST00000537757 LINC00315P59091 139 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-217ENST00000537757 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-217ENST00000537757 ZNF479Q96JC4 524 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-217ENST00000537757 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-217ENST00000537757 JPT2Q9H910 190 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-217ENST00000537757 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-217ENST00000537757 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.71□□□□□ -1.02
LMO3-217ENST00000537757 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LMO3-217ENST00000537757 FHL2Q14192 279 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-217ENST00000537757 OR4C5Q8NGB2 326 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-217ENST00000537757 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.7□□□□□ -1.02
LMO3-217ENST00000537757 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms