RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 RNF114Q9Y508 228 aa5.62□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.62□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 H3BVH4 76 aa5.61□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 M0R143 59 aa5.61□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 EVI2AP22794 236 aa5.61□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 FBN2P35556 2912 aa5.61□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 DEFB114Q30KQ6 69 aa5.61□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 SPATA45Q537H7 98 aa5.61□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.61□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 PRO1933Q9H354 126 aa5.61□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.61□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.61□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 POLQO75417 2590 aa5.61□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.6□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa5.6□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 H3BMM0 161 aa5.6□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 DLEU1O43261 78 aa5.6□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 ZNF688P0C7X2 276 aa5.6□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 LAGE3Q14657 143 aa5.6□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.6□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.6□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 PAM16Q9Y3D7 125 aa5.6□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 APCP25054 2843 aa5.6□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.6□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 ITPR3Q14573 2671 aa5.59□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.59□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 SIVA1O15304 175 aa5.59□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 NPSP0C0P6 89 aa5.59□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 SMIM17P0DL12 118 aa5.59□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 LINC00315P59091 139 aa5.59□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.59□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.59□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 SPXQ9BT56 116 aa5.59□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 ZMAT4Q9H898 229 aa5.59□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 YAE1D1Q9NRH1 226 aa5.59□□□□□ -1.51
PACS1-211ENST00000531298 MUC4Q99102 2169 aa5.58□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 F6UB75 175 aa5.58□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 CCL24O00175 119 aa5.58□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 CIDEAO60543 219 aa5.58□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 IGLL1P15814 213 aa5.58□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 SRD5A1P18405 259 aa5.58□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 SLURP1P55000 103 aa5.58□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.58□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 LINC01006Q8NI28 216 aa5.58□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 ESM1Q9NQ30 184 aa5.58□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 MYO9AB2RTY4 2548 aa5.58□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.57□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.57□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 A8MWV9 139 aa5.57□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 H7C1H1 209 aa5.57□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 VCYO14598 125 aa5.57□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 CD7P09564 240 aa5.57□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 PROK1P58294 105 aa5.57□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 RASL10AQ92737 203 aa5.57□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 RAX2Q96IS3 184 aa5.57□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 DUX5Q96PT3 197 aa5.57□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5.57□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa5.57□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 AGRNO00468 2067 aa5.57□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 CHD6Q8TD26 2715 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 RHODO00212 210 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 GNRH2O43555 120 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 NCR2O95944 276 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 COX8AP10176 69 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 CRYBA4P53673 196 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 RIPPLY3P57055 190 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 DEFB131AP59861 70 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 RHOHQ15669 191 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 LCE3BQ5TA77 95 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 NDUFA11Q86Y39 141 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 Q8N1Y9 231 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 TOMM6Q96B49 74 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 TEX15Q9BXT5 2789 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 SMKR1H3BMG3 65 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 M0R2P5 195 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 INSP01308 110 aa5.55□□□□□ -1.52
PACS1-211ENST00000531298 IGLV1-51P01701 117 aa5.55□□□□□ -1.52
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