RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 RPL7P18124 248 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 ZNF138P52744 262 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 CACNG7P62955 275 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 LYZL1Q6UWQ5 148 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 NEGR1Q7Z3B1 354 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 Q8N6K4 173 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 DEFB124Q8NES8 71 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 OR11H6Q8NGC7 330 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 RPEQ96AT9 228 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 IFI27L1Q96BM0 104 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 RNF185Q96GF1 192 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 DYNLRB1Q9NP97 96 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 RABAC1Q9UI14 185 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 INSIG2Q9Y5U4 225 aa2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 CACNA1DQ01668 2161 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 FAM186AA6NE01 2351 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 A0A1W2PPM0 123 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 TMEM213A2RRL7 107 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 OOSP1A8MZH6 123 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 LINC01619G3V211 115 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 M0R1W7 72 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 M0R3E3 92 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 ENSAO43768 121 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 SCGB2A1O75556 95 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 ATP5LO75964 103 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 NPYP01303 97 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 IGHG4P01861 327 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 EVI2AP22794 236 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 S100A7P31151 101 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 BMI1P35226 326 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 EBI3Q14213 229 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 C5orf64Q2M2E5 130 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 AMN1Q8IY45 258 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 TTC9CQ8N5M4 171 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 CCL17Q92583 94 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 MAP1LC3AQ9H492 121 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 SMPXQ9UHP9 88 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 NAV3Q8IVL0 2385 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa2.95□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 A0A0G2JLM5 398 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 H0Y8G0 127 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 SNAI2O43623 268 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 GNG7O60262 68 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 ZNF861PO60384 105 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 APELAP0DMC3 54 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 PPIAL4GP0DN37 164 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 COX7A1P24310 79 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 FCER1GP30273 86 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 RAB9AP51151 201 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 TAL2Q16559 108 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 MINOS1Q5TGZ0 78 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 ERASQ7Z444 233 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 OR8A1Q8NGG7 326 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 OR2K2Q8NGT1 345 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 ARPC1AQ92747 370 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 VSIG2Q96IQ7 327 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 ATP6V0BQ99437 205 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 VPS25Q9BRG1 176 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 SLC50A1Q9BRV3 221 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 CHAC1Q9BUX1 264 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 C21orf62Q9NYP8 219 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 DPM3Q9P2X0 92 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa2.94□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 A0A1B0GWB2 263 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 G3V4G9 280 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 SMKR1H3BMG3 65 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 H3BUT2 72 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 DPM2O94777 84 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 SCGB1A1P11684 91 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 FABP2P12104 132 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 SLC25A16P16260 332 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 PRTN3P24158 256 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 CKS2P33552 79 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 FXYD2P54710 66 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 DLX1P56177 255 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa2.93□□□□□ -1.94
SGCE-211ENST00000522045 ZNF562Q6V9R5 426 aa2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms