RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506787.5

UBE2B-205, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-205ENST00000506787 Q86TA4 180 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 VGLL1Q99990 258 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.22□□□□□ -1.25
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UBE2B-205ENST00000506787 RAB5AP20339 215 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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UBE2B-205ENST00000506787 C16orf92Q96LL3 132 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-205ENST00000506787 LINC00477Q96M19 166 aa7.22□□□□□ -1.25
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UBE2B-205ENST00000506787 SH2D1AO60880 128 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-205ENST00000506787 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-205ENST00000506787 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-205ENST00000506787 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-205ENST00000506787 DEFB1P60022 68 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-205ENST00000506787 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-205ENST00000506787 Q8TAT8 98 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-205ENST00000506787 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.15□□□□□ -1.26
UBE2B-205ENST00000506787 NDFIP1Q9BT67 221 aa7.15□□□□□ -1.26
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