RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 OR5H6Q8NGV6 325 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 DPY30Q9C005 99 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 MYO16Q9Y6X6 1858 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa2.72□□□□□ -1.97
STRADB-210ENST00000498648 FANCMQ8IYD8 2048 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 DSPPQ9NZW4 1301 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 RTL8CO15255 209 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 TIMM17BO60830 172 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 METTL15P1P0C7V9 234 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 LINC00694P0DN24 101 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 RAB5CP51148 216 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 LINC00315P59091 139 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 KRTAP10-12P60413 245 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 ZNF90Q03938 601 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 PYDC2Q56P42 97 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 C6orf52Q5T4I8 152 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 MORN4Q8NDC4 146 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 DIRC1Q969H9 104 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 PRELID3AQ96N28 172 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 LINC00470Q9BZP3 86 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 NIT2Q9NQR4 276 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 TNFSF18Q9UNG2 199 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 COL12A1Q99715 3063 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 MICAL3Q7RTP6 2002 aa2.71□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 RELNP78509 3460 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 MUC21A0A140T8X8 626 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 ZNF727A8MUV8 499 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 GNG7O60262 68 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 MT-ND6P03923 174 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 GPX1P07203 203 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 QRFPP83859 136 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 KLRD1Q13241 179 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 NEDD8Q15843 81 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 CCSMST1Q4G0I0 132 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 AAED1Q7RTV5 226 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 ARL11Q969Q4 196 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 LINC00467Q9BRT7 94 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 TANC1Q9C0D5 1861 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 SEC16AO15027 2179 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 ARID1AO14497 2285 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 MYLKQ15746 1914 aa2.7□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 CCDC88CQ9P219 2028 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 K7ERU9 68 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 TCRAP04437 139 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 APODP05090 189 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 TRGC1P0CF51 173 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 COPZ1P61923 177 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 ESRGQ1W209 222 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 HSD17B12Q53GQ0 312 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 Q8IYB0 196 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 CMTM2Q8TAZ6 248 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 DEDD2Q8WXF8 326 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 COX14Q96I36 57 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 Q9BRP9 147 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 GGACTQ9BVM4 153 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 FBN3Q75N90 2809 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 FBN2P35556 2912 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 NOTCH2Q04721 2471 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 PTPRBP23467 1997 aa2.69□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 DNHD1Q96M86 4753 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 ASXL3Q9C0F0 2248 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 A0A087WXM4 84 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 GNGT2O14610 69 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 UQCRQO14949 82 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 NCR2O95944 276 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 IGF2P01344 180 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 S100PP25815 95 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 IGFBP7Q16270 282 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 TMEM155Q4W5P6 130 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 CLECL1Q8IZS7 167 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 C10orf111Q8N326 155 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 FAM216BQ8N7L0 139 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 OR4B1Q8NGF8 309 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 TMEM203Q969S6 136 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 BANF2Q9H503 90 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 NDUFB11Q9NX14 153 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 TAS2R4Q9NYW5 299 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 LAMA1P25391 3075 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 FLNCQ14315 2725 aa2.68□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa2.67□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa2.67□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 OR2T8A6NH00 312 aa2.67□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 HMSDA8MTL9 139 aa2.67□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 NPFFO15130 113 aa2.67□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 IFNGP01579 166 aa2.67□□□□□ -1.98
STRADB-210ENST00000498648 PMP2P02689 132 aa2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms