RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489048.1

NEB-215, Transcript of nebulin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEB, Length 2,738 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEB-215ENST00000489048 UBE2D2P62837 147 aa8.28□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.28□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.28□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 PIEZO1Q92508 2521 aa8.28□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 ATMQ13315 3056 aa8.27□□□□□ -1.08
NEB-215ENST00000489048 MGPP08493 103 aa8.27□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 CD7P09564 240 aa8.27□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 LMO4P61968 165 aa8.27□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.27□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.27□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 ZNF292O60281 2723 aa8.27□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 TSHBP01222 138 aa8.27□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.27□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 IGIPA6NJ69 53 aa8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 H3BUA1 57 aa8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 TSPAN13O95857 204 aa8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 SCGB2A2Q13296 93 aa8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 LCNL1Q6ZST4 164 aa8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 A0A1W2PPR1 153 aa8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 APOMO95445 188 aa8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 HERVK_113P61574 105 aa8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 FOXI1Q12951 378 aa8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 TMEM141Q96I45 108 aa8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 TIMM17AQ99595 171 aa8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.26□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 C11orf86A6NJI1 115 aa8.25□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 J3KRW8 73 aa8.25□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 SPRY2O43597 315 aa8.25□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 INSL3P51460 131 aa8.25□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.25□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.25□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 A0A0J9YY99 117 aa8.25□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 A0A1B0GV72 72 aa8.25□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 GNRH2O43555 120 aa8.25□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 PMVKQ15126 192 aa8.25□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 USMG5Q96IX5 58 aa8.25□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 KLLNB2CW77 178 aa8.24□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 TRBV12-3P01733 135 aa8.24□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.24□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 MTURNQ8N3F0 131 aa8.24□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 KLRB1Q12918 225 aa8.24□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 NDUFA11Q86Y39 141 aa8.24□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 SBSPONQ8IVN8 264 aa8.24□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.24□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 TACC2O95359 2948 aa8.24□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.24□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 FOXC1Q12948 553 aa8.23□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 TMEM219Q86XT9 240 aa8.23□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 ABCA4P78363 2273 aa8.23□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.23□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 IGHV3-30P01768 117 aa8.23□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.23□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.23□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 TTC28Q96AY4 2481 aa8.23□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 WNK2Q9Y3S1 2297 aa8.23□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 VCYO14598 125 aa8.23□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 DEFB1P60022 68 aa8.23□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.23□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.23□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.23□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 CDIP1Q9H305 208 aa8.23□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.22□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 LGALS9O00182 355 aa8.22□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 ZNF876PQ49A33 203 aa8.22□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 NFE4Q86UQ8 179 aa8.22□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 AMELXQ99217 191 aa8.22□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.22□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 F6UB75 175 aa8.22□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 VCX2Q9H322 139 aa8.22□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.22□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 IGHG2P01859 326 aa8.21□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 PSMB2P49721 201 aa8.21□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.21□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 KIR2DL4Q99706 377 aa8.21□□□□□ -1.09
NEB-215ENST00000489048 IGHV1-69P01742 117 aa8.21□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 CFC1BP0CG36 223 aa8.21□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 CFC1P0CG37 223 aa8.21□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 CLEC2AQ6UVW9 174 aa8.21□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 M0QXV9 152 aa8.2□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 TEN1Q86WV5 123 aa8.2□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.2□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 SYT8Q8NBV8 401 aa8.2□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.2□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.2□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.2□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.2□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 TCL1BO95988 128 aa8.2□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.2□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.2□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 Q6ZS46 218 aa8.2□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.2□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 ODF3Q96PU9 254 aa8.2□□□□□ -1.1
NEB-215ENST00000489048 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.2□□□□□ -1.1
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