RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 MAFIPQ8WZ33 124 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 CLEC2BQ92478 149 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 TMEM141Q96I45 108 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 MCEEQ96PE7 176 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 LINC00472Q9H8W2 130 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 BET1LQ9NYM9 111 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 SSR3Q9UNL2 185 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.86□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 ITPR1Q14643 2758 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 C5orf58C9J3I9 102 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 PIN1P1O15428 100 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 TPST1O60507 370 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 NCR2O95944 276 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 ACYP2P14621 99 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 SDC4P31431 198 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 CAPZBP47756 277 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 AKR1D1P51857 326 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 MT1HP80294 61 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 RTL8BQ17RB0 113 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 NUP35Q8NFH5 326 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 OR4B1Q8NGF8 309 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 DMAC1Q96GE9 116 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 CARD19Q96LW7 228 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 RTL8AQ9BWD3 113 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 SH3BGRL3Q9H299 93 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 BATF3Q9NR55 127 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 OTORQ9NRC9 128 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 IL20Q9NYY1 176 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 TRPM7Q96QT4 1865 aa-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 LRRK2Q5S007 2527 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 RBAKDNA6NC62 111 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 TMEM14DPA8MWL7 114 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 H3BNG1 76 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 APOC1P02654 83 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 PYYP10082 97 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 TAS2R41P59536 307 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 DNAJB13P59910 316 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 EMX2Q04743 252 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 INSL4Q14641 139 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 CCSMST1Q4G0I0 132 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 DEFB105AQ8NG35 78 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 NEK7Q8TDX7 302 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 PHB2Q99623 299 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 C19orf12Q9NSK7 152 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 SSC5DA1L4H1 1573 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 PIK3C2AO00443 1686 aa-0.88□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 URB1O60287 2271 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 K7EP34 96 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 CDC42EP2O14613 210 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 CTXN2P0C2S0 81 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 BCL2P10415 239 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 IL7P13232 177 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 HAMPP81172 84 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 SLC48A1Q6P1K1 146 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 OR4S1Q8NGB4 309 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 OR8J3Q8NGG0 315 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 PBDC1Q9BVG4 233 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 PARVGQ9HBI0 331 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 FKBP11Q9NYL4 201 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 SS18L2Q9UHA2 77 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 MPC1Q9Y5U8 109 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 KALRNO60229 2985 aa-0.89□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 ANK1P16157 1881 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 RREB1Q92766 1687 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 TMEM189A5PLL7 270 aa-0.9□□□□□ -2.55
SENP6-210ENST00000487548 H3BQV1 296 aa-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms