RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 A8MTW9 85 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 DIRC3C9JPN6 131 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 H7BYZ3 331 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 GCGP01275 180 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 AZU1P20160 251 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 GALR1P47211 349 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 C1orf194Q5T5A4 169 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 AMTNQ6UX39 209 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 OR4B1Q8NGF8 309 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 CMTM2Q8TAZ6 248 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 SFRP2Q96HF1 295 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 GPR82Q96P67 336 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 PRELID1Q9Y255 219 aa4.89□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 PRAC2D3DTV9 90 aa4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 F6UB75 175 aa4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 SOCS3O14543 225 aa4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 CRXO43186 299 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF253O75346 499 aa4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 LTAP01374 205 aa4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 S100A9P06702 114 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 MGST1P10620 155 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 RAB5AP20339 215 aa4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 UBE2G1P62253 170 aa4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 PRNTQ86SH4 94 aa4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 Q86TA4 180 aa4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 BAGE2Q86Y30 109 aa4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 RNF182Q8N6D2 247 aa4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 FMC1Q96HJ9 113 aa4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 A0A0J9YX75 114 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 A0A0J9YY99 117 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 H3BNG1 76 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 PPP1R2P9O14990 202 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 SIVA1O15304 175 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 HOXA5P20719 270 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 CSN1S1P47710 185 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 PSG3Q16557 428 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 Q6ZSA8 131 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 NFE4Q86UQ8 179 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM183AQ8IXX5 376 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 SLC50A1Q9BRV3 221 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 MLST8Q9BVC4 326 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 OSTCQ9NRP0 149 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 PSG8Q9UQ74 426 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 V9GYV3 84 aa4.87□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 S100PP25815 95 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 MEOX2P50222 304 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 PRR27Q6MZM9 219 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 SMIM12Q96EX1 92 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 NUDT11Q96G61 164 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 C20orf173Q96LM9 149 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 C8orf49Q96NF6 230 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 IMMP2LQ96T52 175 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 VGLL1Q99990 258 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM208Q9BTX3 173 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 IL36BQ9NZH7 164 aa4.86□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 A0A096LPF7 62 aa4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 K7EQM0 130 aa4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 MT1HL1P0DM35 61 aa4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 CRIP1P50238 77 aa4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 ERCC8Q13216 396 aa4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 KCNIP4Q6PIL6 250 aa4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 ZFP82Q8N141 532 aa4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 Q8TAT8 98 aa4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 C16orf92Q96LL3 132 aa4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF492Q9P255 531 aa4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.84□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.84□□□□□ -1.63
CASQ1-203ENST00000481081 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms