RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478076.5

FAM107B-217, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, human

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene FAM107B, Length 790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM107B-217	ENST00000478076	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076		Q6ZWC4	215 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076		A0A1B0GUT8	65 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076		A0A1B0GXF2	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	SCO1	O75880	301 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	NXPH4	O95158	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	S100A8	P05109	93 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	ASIP	P42127	132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	FXYD7	P58549	80 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	CACNG7	P62955	275 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076		Q6ZQT7	251 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	LINC01587	Q99440	93 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	SPX	Q9BT56	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076		J3KRW8	73 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	GNRH2	O43555	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	SPRY2	O43597	315 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	MT-ND6	P03923	174 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	TCL1A	P56279	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	RIG	Q13278	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	RNF183	Q96D59	192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	CBY3	A6NI87	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	GZMB	P10144	247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	RAB5A	P20339	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	HBB	P68871	147 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	RASL10A	Q92737	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	FRZB	Q92765	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	RYR1	P21817	5038 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	HERC2	O95714	4834 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076		M0R2P5	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	CIDEA	O60543	219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	MIF	P14174	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	NTF3	P20783	257 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076		X6R8D5	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076		H3BVH4	76 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	PHOX2A	O14813	284 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	SPINK4	O60575	86 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	AZU1	P20160	251 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
FAM107B-217	ENST00000478076	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms