RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471643.1

RALGPS1-211, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 681 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-211ENST00000471643 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.1□□□□□ -0.95
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RALGPS1-211ENST00000471643 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
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RALGPS1-211ENST00000471643 RNF185Q96GF1 192 aa9.08□□□□□ -0.96
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RALGPS1-211ENST00000471643 MPV17L2Q567V2 206 aa9.05□□□□□ -0.96
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RALGPS1-211ENST00000471643 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.02□□□□□ -0.97
RALGPS1-211ENST00000471643 PRR34Q9NV39 138 aa9.02□□□□□ -0.97
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RALGPS1-211ENST00000471643 UBE2D2P62837 147 aa9.01□□□□□ -0.97
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RALGPS1-211ENST00000471643 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.01□□□□□ -0.97
RALGPS1-211ENST00000471643 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.01□□□□□ -0.97
RALGPS1-211ENST00000471643 GTSF1Q8WW33 167 aa9.01□□□□□ -0.97
RALGPS1-211ENST00000471643 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9□□□□□ -0.97
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RALGPS1-211ENST00000471643 MBD2Q9UBB5 411 aa9□□□□□ -0.97
RALGPS1-211ENST00000471643 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.99□□□□□ -0.97
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RALGPS1-211ENST00000471643 OR5C1Q8NGR4 320 aa8.98□□□□□ -0.97
RALGPS1-211ENST00000471643 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
RALGPS1-211ENST00000471643 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.98□□□□□ -0.97
RALGPS1-211ENST00000471643 A0A0U1RQV1 116 aa8.97□□□□□ -0.97
RALGPS1-211ENST00000471643 NAP1L6A6NFF2 107 aa8.97□□□□□ -0.97
RALGPS1-211ENST00000471643 S100A10P60903 97 aa8.97□□□□□ -0.97
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RALGPS1-211ENST00000471643 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.97□□□□□ -0.97
RALGPS1-211ENST00000471643 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.96□□□□□ -0.98
RALGPS1-211ENST00000471643 RHODO00212 210 aa8.96□□□□□ -0.98
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RALGPS1-211ENST00000471643 KHDC3LQ587J8 217 aa8.96□□□□□ -0.98
RALGPS1-211ENST00000471643 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.96□□□□□ -0.98
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