RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 KDELR2P33947 212 aa-1.58□□□□□ -2.66
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SHQ1-204ENST00000468347 SLAMF1Q13291 335 aa-1.58□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 OR2F1Q13607 317 aa-1.58□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 BCL2L15Q5TBC7 163 aa-1.58□□□□□ -2.66
SHQ1-204ENST00000468347 C3orf33Q6P1S2 294 aa-1.58□□□□□ -2.66
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SHQ1-204ENST00000468347 VPS29Q9UBQ0 182 aa-1.62□□□□□ -2.67
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