RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 ERCC8Q13216 396 aa3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 PATE2Q6UY27 113 aa3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 OR1L4Q8NGR5 311 aa3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 ATP5SQ99766 215 aa3.35□□□□□ -1.87
CBX1-204ENST00000444685 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa3.35□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.34□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 ZNF253O75346 499 aa3.34□□□□□ -1.87
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CBX1-204ENST00000444685 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.33□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa3.33□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 A0A0U1RQV1 116 aa3.33□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 S100A8P05109 93 aa3.33□□□□□ -1.88
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CBX1-204ENST00000444685 RHOHQ15669 191 aa3.33□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 CLLU1Q5K131 121 aa3.33□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 SLC25A29Q8N8R3 303 aa3.33□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.33□□□□□ -1.88
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CBX1-204ENST00000444685 C20orf85Q9H1P6 137 aa3.33□□□□□ -1.88
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CBX1-204ENST00000444685 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa3.32□□□□□ -1.88
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CBX1-204ENST00000444685 METTL15P1P0C7V9 234 aa3.32□□□□□ -1.88
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CBX1-204ENST00000444685 CAMLGP49069 296 aa3.32□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 IL18Q14116 193 aa3.32□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 SMIM4Q8WVI0 70 aa3.32□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 KCNS1Q96KK3 526 aa3.32□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 TCEAL7Q9BRU2 100 aa3.32□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 LRP2P98164 4655 aa3.31□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 C5orf51A6NDU8 294 aa3.31□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 L7N2F9 121 aa3.31□□□□□ -1.88
CBX1-204ENST00000444685 TAAR5O14804 337 aa3.31□□□□□ -1.88
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