RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 PRNTQ86SH4 94 aa14.09□□□□□ -0.15
LIMS1-208ENST00000428064 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.08□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 PGPEP1LA6NFU8 196 aa14.08□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 GIPP09681 153 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 GCSHP23434 173 aa14.08□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 PSCAO43653 123 aa14.07□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 OR10J3Q5JRS4 329 aa14.07□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 ZFP2Q6ZN57 461 aa14.07□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 GTSF1LQ9H1H1 148 aa14.07□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 RNF222A6NCQ9 220 aa14.06□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 LAGE3Q14657 143 aa14.06□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa14.06□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa14.05□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa14.05□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 A8MWV9 139 aa14.05□□□□□ -0.16
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LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.05□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.04□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa14.04□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00694P0DN24 101 aa14.04□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF726P1Q15940 193 aa14.04□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 FRZBQ92765 325 aa14.04□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 PARLQ9H300 379 aa14.04□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.04□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 HERC1Q15751 4861 aa14.03□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 FABP5P3A8MUU1 101 aa14.03□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 Q5VSD8 79 aa14.03□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 Q8N814 137 aa14.03□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 LINC00479Q96M42 142 aa14.03□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 IL36BQ9NZH7 164 aa14.03□□□□□ -0.16
LIMS1-208ENST00000428064 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa14.02□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.02□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.02□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 HIST1H2BAQ96A08 127 aa14.02□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM70Q9BUB7 260 aa14.02□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.01□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 PEX7O00628 323 aa14.01□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 INAFM2P0DMQ5 153 aa14.01□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 S100A4P26447 101 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 ASIPP42127 132 aa14.01□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 DNLZQ5SXM8 178 aa14.01□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 Q86TA4 180 aa14.01□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 FAM74A7A6NL05 159 aa14□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 IFNA7P01567 189 aa14□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-30P01768 117 aa14□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-33P01772 117 aa14□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 UFSP1Q6NVU6 142 aa14□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 Q6ZSN1 163 aa14□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 Q9HAA7 133 aa14□□□□□ -0.17
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LIMS1-208ENST00000428064 UBE2G2P60604 165 aa13.98□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 OR2T35Q8NGX2 323 aa13.98□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 ZFP30Q9Y2G7 519 aa13.98□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 A0A087WWC5 75 aa13.97□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 B4DEV8 164 aa13.97□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 RHODO00212 210 aa13.97□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa13.97□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 TCEAL7Q9BRU2 100 aa13.97□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 MYCBP2O75592 4640 aa13.96□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa13.96□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 GAGE12JA6NER3 117 aa13.96□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 KRBOX1C9JBD0 128 aa13.96□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 C1QBP02746 253 aa13.96□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 CRIP1P50238 77 aa13.96□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 GAGE1Q13065 139 aa13.96□□□□□ -0.17
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LIMS1-208ENST00000428064 GAGE5Q13069 117 aa13.96□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 GAGE13Q4V321 117 aa13.96□□□□□ -0.17
LIMS1-208ENST00000428064 SYT8Q8NBV8 401 aa13.96□□□□□ -0.17
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LIMS1-208ENST00000428064 TOR2AQ5JU69 321 aa13.95□□□□□ -0.18
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LIMS1-208ENST00000428064 FHITP49789 147 aa13.94□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 FAM162BQ5T6X4 162 aa13.94□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 SAMD10Q9BYL1 202 aa13.94□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 JPT2Q9H910 190 aa13.94□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa13.93□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 FAM229AH3BQW9 127 aa13.93□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 SH2D1AO60880 128 aa13.93□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.93□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 Q8N3U1 123 aa13.93□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 OR11H4Q8NGC9 324 aa13.93□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.93□□□□□ -0.18
LIMS1-208ENST00000428064 UBE2G1P62253 170 aa13.92□□□□□ -0.18
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