RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 CACNG7P62955 275 aa14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-202ENST00000394272 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HDDC3-202ENST00000394272 C5orf52A6NGY3 159 aa14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 NDUFA6P56556 154 aa14.82□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 SPANXN1Q5VSR9 72 aa14.82□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 C9orf85Q96MD7 179 aa14.82□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 LINC00467Q9BRT7 94 aa14.82□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM191AQ9H0A3 160 aa14.82□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 MDFICQ9P1T7 246 aa14.82□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa14.82□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 TRGV11A0A075B6L2 103 aa14.81□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 SPRY2O43597 315 aa14.81□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 C1orf158Q8N1D5 194 aa14.81□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 NXPH4O95158 308 aa14.8□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 SRIP30626 198 aa14.8□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 DMRTA1Q5VZB9 504 aa14.8□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 FAM104BQ5XKR9 115 aa14.8□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 CBY3A6NI87 242 aa14.8□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 AMN1Q8IY45 258 aa14.8□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 LINC01587Q99440 93 aa14.8□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 M0R381 172 aa14.79□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.79□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.78□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa14.78□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 PRM2P04554 102 aa14.78□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 HTN1P15515 57 aa14.78□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 EVI2AP22794 236 aa14.78□□□□□ -0.04
HDDC3-202ENST00000394272 Q0VG73 95 aa14.77□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa14.77□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 RNF185Q96GF1 192 aa14.77□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa14.77□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 UBE2CO00762 179 aa14.76□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 HOXA5P20719 270 aa14.76□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 OR10J3Q5JRS4 329 aa14.76□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 RAB4AP20338 218 aa14.75□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 C18orf32Q8TCD1 76 aa14.75□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.75□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 DNAH3Q8TD57 4116 aa14.75□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 SMIM15Q7Z3B0 74 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 C11orf72Q8NBR9 251 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 CSTL1Q9H114 145 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 U3KQK5 164 aa14.74□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF415Q09FC8 603 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 MDFIQ99750 246 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa14.73□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 D6R8Y8 96 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 LINC00310P59036 64 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 AP1S3Q96PC3 154 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 AZU1P20160 251 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 KRTAP10-11P60412 298 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 HIST3H2BBQ8N257 126 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 SYT8Q8NBV8 401 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.72□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 IQCJQ1A5X6 159 aa14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 BAGE3Q86Y29 109 aa14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 ORMDL3Q8N138 153 aa14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 DPH3P1Q9H4G8 78 aa14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa14.71□□□□□ -0.05
HDDC3-202ENST00000394272 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 IFITM10A6NMD0 228 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 NUPR1O60356 82 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 CKS2P33552 79 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF876PQ49A33 203 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 RCHY1Q96PM5 261 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 SERF1AO75920 110 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 PPBPP02775 128 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 KIR2DL5AQ8N109 375 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 IL17DQ8TAD2 202 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 PTH2Q96A98 100 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 JPT2Q9H910 190 aa14.69□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 SMKR1H3BMG3 65 aa14.68□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 M0R2P5 195 aa14.68□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 ESDP10768 282 aa14.68□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 LINC00315P59091 139 aa14.68□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.68□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 PRELID3AQ96N28 172 aa14.68□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 GAS8-AS1O95177 125 aa14.67□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 NCR2O95944 276 aa14.67□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa14.67□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.67□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 SPXQ9BT56 116 aa14.67□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 G3V4G9 280 aa14.66□□□□□ -0.06
HDDC3-202ENST00000394272 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms