RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP10-9P60411 292 aa8.66□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.66□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.66□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.66□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 DLX6P56179 175 aa8.66□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 FOXI1Q12951 378 aa8.66□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 LY6G5BQ8NDX9 201 aa8.66□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 DUX3Q96PT4 197 aa8.66□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 COL12A1Q99715 3063 aa8.66□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.66□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.66□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.66□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa8.65□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 ATP5LO75964 103 aa8.65□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.65□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 PSMB2P49721 201 aa8.65□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 PTH2Q96A98 100 aa8.65□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 IGKV1-17P01599 117 aa8.65□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF688P0C7X2 276 aa8.65□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 RNF183Q96D59 192 aa8.65□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
RPRD1B-201ENST00000373433 PSMG4Q5JS54 123 aa8.65□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 RNF125Q96EQ8 232 aa8.65□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.64□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.64□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.64□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 SIRPDQ9H106 197 aa8.64□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 PRO0461Q9UI25 63 aa8.64□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 ITPR3Q14573 2671 aa8.64□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 PIFOQ8TCI5 191 aa8.64□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.64□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 ZMAT4Q9H898 229 aa8.64□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.64□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 OR11H12B2RN74 326 aa8.63□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 H3BVH4 76 aa8.63□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 XGP55808 180 aa8.63□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 OR11H1Q8NG94 326 aa8.63□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 OR11H2Q8NH07 326 aa8.63□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 H3BRN7 92 aa8.63□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa8.63□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 CDIP1Q9H305 208 aa8.63□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.038e-9■□□□□ 8.9
RPRD1B-201ENST00000373433 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.63□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 Q6ZUT4 128 aa8.63□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.62□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 PRR25Q96S07 402 aa8.62□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 LINC01549A6NIU2 74 aa8.62□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 ID1P41134 155 aa8.62□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 NFE4Q86UQ8 179 aa8.62□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.62□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 RNF185Q96GF1 192 aa8.62□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 TACC2O95359 2948 aa8.62□□□□□ -1.03
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RPRD1B-201ENST00000373433 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.62□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 J3QLI3 93 aa8.62□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 FCN3O75636 299 aa8.62□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 TAL2Q16559 108 aa8.62□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.62□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 HLA-DMBP28068 263 aa8.61□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 WFDC11Q8NEX6 87 aa8.61□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.61□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 I3L2K1 104 aa8.61□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 TEX22C9J3V5 150 aa8.6□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 ATP6V0E1O15342 81 aa8.6□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 FHL3Q13643 280 aa8.6□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 SYNJ2BPP57105 145 aa8.6□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 DEFB112Q30KQ8 113 aa8.6□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.6□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 B5MCH6 92 aa8.6□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.6□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.6□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.59□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 Q8N8P6 123 aa8.59□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.59□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 IGLC6P0CF74 106 aa8.59□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 HLA-DRB4P13762 266 aa8.59□□□□□ -1.03
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RPRD1B-201ENST00000373433 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.59□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.59□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A087WX48 190 aa8.59□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF56Q15929 161 aa8.59□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.59□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.59□□□□□ -1.03
RPRD1B-201ENST00000373433 LINC01548A6NM66 108 aa8.58□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 K7EIM0 57 aa8.58□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 IGHV4-59P01825 116 aa8.58□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 PLNP26678 52 aa8.58□□□□□ -1.04
RPRD1B-201ENST00000373433 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
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