RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM37Q8WXS4 190 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 MGST2Q99735 147 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 SRRQ9GZT4 340 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 FLVCR2Q9UPI3 526 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 TRBV19A0A075B6N1 114 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 C7orf71A4D174 169 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 K7EP13 123 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 SLC17A3O00476 420 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 CST7O76096 145 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 NMBP08949 121 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 SULT1A1P50225 295 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 BAXQ07812 192 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 MIC13Q5XKP0 118 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 C2orf50Q96LR7 162 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 C18orf15Q96N68 181 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 LINC00467Q9BRT7 94 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF586Q9NXT0 402 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM14CQ9P0S9 112 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 FUT9Q9Y231 359 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 ICOSQ9Y6W8 199 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 TRAV5A0A0B4J249 113 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 M0R3E3 92 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 CCSO14618 274 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 LYRM1O43325 122 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 SPINK4O60575 86 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 IFNA5P01569 189 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 NBEAP1P0C6P0 100 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 IL7P13232 177 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 FGF7P21781 194 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 EVI2AP22794 236 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 CSN1S1P47710 185 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 TCL1AP56279 114 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 LINC00315P59091 139 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 S100A10P60903 97 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 ERCC8Q13216 396 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 VWC2Q2TAL6 325 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 BLNKQ8WV28 456 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 PRO0255Q9UI72 69 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 HERC1Q15751 4861 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 MYCBP2O75592 4640 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 TRAV6A0A075B6T7 132 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 A0A096LPF7 62 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 ORM1P02763 201 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 TCRBP04435 133 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 CRISP2P16562 243 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 BTCP35070 178 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF138P52744 262 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 BTN1A1Q13410 526 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 C11orf72Q8NBR9 251 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 SPXQ9BT56 116 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 PAXXQ9BUH6 204 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 OR51M1Q9H341 326 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 NUDT15Q9NV35 164 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 NDUFA13Q9P0J0 144 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 LY96Q9Y6Y9 160 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 IGSF23A1L1A6 192 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 RBAKDNA6NC62 111 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 C9JCJ5 164 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 E5RGE8 158 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRC-204ENST00000367379 C17orf112F2Z3M2 114 aa3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms