RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362954.1

RNU6-199P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 199, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-199P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-199P-201ENST00000362954 PPDPFLQ8WWR9 84 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-199P-201ENST00000362954 DSCR8Q96T75 97 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-199P-201ENST00000362954 SPRR2GQ9BYE4 73 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-199P-201ENST00000362954 SLC35B3Q9H1N7 401 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-199P-201ENST00000362954 GINS2Q9Y248 185 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-199P-201ENST00000362954 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-199P-201ENST00000362954 CELSR2Q9HCU4 2923 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-199P-201ENST00000362954 IGF2RP11717 2491 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-199P-201ENST00000362954 KDM5CP41229 1560 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-199P-201ENST00000362954 ARAP1Q96P48 1450 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-199P-201ENST00000362954 KIF13AQ9H1H9 1805 aa-0.03□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 JMJD1CQ15652 2540 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 COL7A1Q02388 2944 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 TRAV2A0A0B4J234 112 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 A0A1B0GW64 132 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 TNFSF15O95150 251 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 SCTP09683 121 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 HLA-DRB4P13762 266 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 AKR1D1P51857 326 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 EMX2Q04743 252 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 OR8B8Q15620 311 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 Q5BKY6 102 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 TMEM141Q96I45 108 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 SELENOSQ9BQE4 189 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 COA4Q9NYJ1 87 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 BET1LQ9NYM9 111 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 TAS2R8Q9NYW2 309 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 CALML5Q9NZT1 146 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 HSPB11Q9Y547 144 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 NCOR2Q9Y618 2525 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 F5P12259 2224 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 CCDC171Q6TFL3 1326 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 IGSF10Q6WRI0 2623 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 MCRIP1C9JLW8 97 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 H0YJX3 145 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 DEGS1O15121 323 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 SMIM24O75264 130 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 SPINK1P00995 79 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 APOC1P02654 83 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 SLC25A6P12236 298 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 OR2T2Q6IF00 324 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 SNX29P2Q8IUI4 249 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 TCTE3Q8IZS6 198 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 DYNLRB2Q8TF09 96 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 VPS25Q9BRG1 176 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 PRR15LQ9BU68 103 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 BANF2Q9H503 90 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 HIGD1AQ9Y241 93 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 MYO7AQ13402 2215 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 SOGA1O94964 1423 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 PIEZO1Q92508 2521 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 POLQO75417 2590 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 MYH13Q9UKX3 1938 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 A0A087WTM6 91 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 CMPK1P30085 196 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 B2MP61769 119 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 CLLU1Q5K131 121 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 NDUFA11Q86Y39 141 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 IFI27L1Q96BM0 104 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 PTPRMP28827 1452 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 DOCK11Q5JSL3 2073 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 CACNA1CQ13936 2221 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 F2Z2F3 143 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 M0R2P5 195 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 YPEL1O60688 119 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 RBP4P02753 201 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 CCL3L1P16619 93 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 NPC2P61916 151 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 TAC4Q86UU9 113 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 BPESC1Q9GZL8 116 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 SPANXA1Q9NS26 97 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 SPANXCQ9NY87 97 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 SSC5DA1L4H1 1573 aa-0.07□□□□□ -2.42
RNU6-199P-201ENST00000362954 UNC13BO14795 1591 aa-0.07□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms