RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 DEFB108AA8MXU0 73 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 SRRM5B3KS81 715 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 FXYD3Q14802 87 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 MSMPQ1L6U9 139 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 AAMDCQ9H7C9 122 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 RELNP78509 3460 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 TRBV19A0A075B6N1 114 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 TRAV41A0A0B4J266 112 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 IGHV3-43DP0DP04 118 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 SAA4P35542 130 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 CENPWQ5EE01 88 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 ZNRF1Q8ND25 227 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 PLPPR2Q96GM1 343 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 AGRNO00468 2067 aa3.81□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 PLAC8L1A1L4L8 177 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 H3BP45 60 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 HBBP68871 147 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 BSPH1Q075Z2 132 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 ORMDL2Q53FV1 153 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 SDIM1Q6ZPB5 146 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 CD177Q8N6Q3 437 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 LY6G5BQ8NDX9 201 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 PEX7O00628 323 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 CFHR3Q02985 330 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 FAM104BQ5XKR9 115 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 C22orf34Q6ZV56 151 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 OR8A1Q8NGG7 326 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 DCTN5Q9BTE1 182 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 ZZEF1O43149 2961 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 IGHV1-46P01743 117 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 DYNLRB1Q9NP97 96 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 TANC2Q9HCD6 1990 aa3.8□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 IAPPP10997 89 aa3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 NUP37Q8NFH4 326 aa3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 S1PR3Q99500 378 aa3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 A0A0G2JRQ6 117 aa3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 IGLV2-14P01704 120 aa3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 SYNJ2BPP57105 145 aa3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 FHL2Q14192 279 aa3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 SS18Q15532 418 aa3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 PSENENQ9NZ42 101 aa3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 A0A096LNJ9 63 aa3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 CCL17Q92583 94 aa3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 METTL26Q96S19 204 aa3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 C8orf87E5RJ46 101 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 IGKV1-5P01602 117 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 IGLV2-8P01709 118 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 FCER1GP30273 86 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 SPANXN5Q5MJ07 72 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 CCL13Q99616 98 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM243Q9BU79 118 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 KALRNO60229 2985 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 IGKV1-39P01597 117 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 IGKV1D-39P04432 117 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 MIC13Q5XKP0 118 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 Q6ZRM9 215 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 FAM216BQ8N7L0 139 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.78□□□□□ -1.8
CLVS1-201ENST00000325897 C17orf98A8MV24 154 aa3.78□□□□□ -1.81
CLVS1-201ENST00000325897 LHBP01229 141 aa3.78□□□□□ -1.81
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.81
CLVS1-201ENST00000325897 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.78□□□□□ -1.81
CLVS1-201ENST00000325897 DCANP1Q8TF63 244 aa3.78□□□□□ -1.81
CLVS1-201ENST00000325897 LEAP2Q969E1 77 aa3.78□□□□□ -1.81
CLVS1-201ENST00000325897 NABP2Q9BQ15 211 aa3.78□□□□□ -1.81
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF492Q9P255 531 aa3.78□□□□□ -1.81
CLVS1-201ENST00000325897 DSCAMO60469 2012 aa3.77□□□□□ -1.81
CLVS1-201ENST00000325897 HIGD1CA8MV81 97 aa3.77□□□□□ -1.81
CLVS1-201ENST00000325897 TIMM17BO60830 172 aa3.77□□□□□ -1.81
CLVS1-201ENST00000325897 ARL14EPLP0DKL9 152 aa3.77□□□□□ -1.81
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF138P52744 262 aa3.77□□□□□ -1.81
CLVS1-201ENST00000325897 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
CLVS1-201ENST00000325897 LINC00205P59089 165 aa3.77□□□□□ -1.81
CLVS1-201ENST00000325897 ATXN8Q156A1 80 aa3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms