RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 TRAV41A0A0B4J266 112 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-201ENST00000295718 CLUHP3Q96NS8 147 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-201ENST00000295718 ERG28Q9UKR5 140 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-201ENST00000295718 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-201ENST00000295718 OVOL3O00110 214 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-201ENST00000295718 VCX2Q9H322 139 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-201ENST00000295718 C11orf21Q9P2W6 132 aa11.15□□□□□ -0.62
PTPRN-201ENST00000295718 KNCNA6PVL3 124 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 CRYGBP07316 175 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa11.15□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 IGLC6P0CF74 106 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 C8orf31Q8N9H6 132 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF876PQ49A33 203 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 BPESC1Q9GZL8 116 aa11.14□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 KLK9Q9UKQ9 250 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 ID1P41134 155 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 GAGE2BQ13066 116 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 GAGE2EQ4V326 116 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 SDHAF1A6NFY7 115 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 TCF15Q12870 199 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 ZFAND6Q6FIF0 208 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 IGFL3Q6UXB1 125 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 HHLA3Q9XRX5 114 aa11.13□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 SS18L2Q9UHA2 77 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 COX6CP09669 75 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 MRAP2Q96G30 205 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 E9PLD3 99 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 MT-ATP8P03928 68 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 HIGD1BQ9P298 99 aa11.12□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM95Q3KNT9 176 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 C9orf139Q6ZV77 190 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 B5MCH6 92 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 LINC01559Q495D7 138 aa11.11□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 OR11H6Q8NGC7 330 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 C11orf86A6NJI1 115 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 TRBV12-3P01733 135 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 CD28P10747 220 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 CRYBA4P53673 196 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 FOXI1Q12951 378 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 CENPEQ02224 2701 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 H3BUX3 64 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 C3orf56Q8N813 242 aa11.1□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 M0R1W7 72 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 Q8N9W7 124 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 PPDPFLQ8WWR9 84 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 BAALCQ8WXS3 180 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 SPINK13Q1W4C9 94 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 U3KQK5 164 aa11.09□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 VCYO14598 125 aa11.08□□□□□ -0.63
PTPRN-201ENST00000295718 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 OVOL1O14753 267 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 PPP1R17O96001 155 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 TM2D2Q9BX73 214 aa11.08□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 SLC25A20O43772 301 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 PMVKQ15126 192 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 PIP4P1Q86T03 277 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 GATD1Q8NB37 220 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 PRO1854Q9UHT4 67 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 J3QQQ9 107 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 NPFFO15130 113 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 TAL2Q16559 108 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 MEIG1Q5JSS6 88 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 A4D1N5 150 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 MINOS1Q5TGZ0 78 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 C2orf82Q6UX34 121 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 LY6DQ14210 128 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 NPBQ8NG41 125 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 TSPAN13O95857 204 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 PRR9Q5T870 116 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 JMJD1CQ15652 2540 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRN-201ENST00000295718 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.2 ms