RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 GATD1Q8NB37 220 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 CST9LQ9H4G1 147 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 GAGE10A6NGK3 116 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 AMTNQ6UX39 209 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 VPS25Q9BRG1 176 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 IGKCP01834 107 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 RASL10AQ92737 203 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa6.54□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 A0A0G2JLM5 398 aa6.53□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 PSMG4Q5JS54 123 aa6.53□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.53□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 AP1S3Q96PC3 154 aa6.53□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 TENM4Q6N022 2769 aa6.53□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.53□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.53□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.53□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 DPF1Q92782 380 aa6.53□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
GINS1-201ENST00000262460 RAB9AP51151 201 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP10-9P60411 292 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 LAGE3Q14657 143 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 MDFICQ9P1T7 246 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 Q9UF83 564 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 TGFAP01135 160 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 CD7P09564 240 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SYNJ2BPP57105 145 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 Q8N8P6 123 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 U3KQE9 123 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SFTPCP11686 197 aa6.51□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.51□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.51□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 CNFNQ9BYD5 112 aa6.51□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 CSTL1Q9H114 145 aa6.51□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.51□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 KNCNA6PVL3 124 aa6.51□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 MSMBP08118 114 aa6.51□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 PRORYQ9H606 182 aa6.51□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 HIVEP2P31629 2446 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SOCS3O14543 225 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 DPM2O94777 84 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 P0DMU3 169 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 FAM231AP0DMU4 169 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 FAM231CP0DMU5 169 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 PROK1P58294 105 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 RNF223E7ERA6 249 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 ASIPP42127 132 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 A6NDX4 124 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 C9orf118A6NHY6 69 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 PPBPP02775 128 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 RBAKDNA6NC62 111 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 IGHG2P01859 326 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.49□□□□□ -1.371e-6■■■■□ 20.8
GINS1-201ENST00000262460 HSD52Q0P140 79 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 ZNF580Q9UK33 172 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS1-201ENST00000262460 HIST1H4GQ99525 98 aa6.48□□□□□ -1.37
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