RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246024.6

TMX4-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX4, Length 6,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-201ENST00000246024 MP68P56378 58 aa10.57□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 Q6ZS49 121 aa10.57□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 CTSZQ9UBR2 303 aa10.57□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 NCR3O14931 201 aa10.56□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 IGHV2-5P01817 119 aa10.56□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 SEC61GP60059 68 aa10.56□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 PYY3Q5JQD4 70 aa10.56□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 CEND1Q8N111 149 aa10.56□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 C17orf77Q96MU5 243 aa10.56□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 RNF138Q8WVD3 245 aa10.56□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 A0A1B0GX51 115 aa10.56□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 C9orf118A6NHY6 69 aa10.56□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 VSIG2Q96IQ7 327 aa10.56□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 GPHB5Q86YW7 130 aa10.56□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 BLCAPP62952 87 aa10.55□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 Q0VG73 95 aa10.55□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 DEFB135Q30KP9 77 aa10.55□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 TECTAO75443 2155 aa10.55□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 IGLC2P0DOY2 106 aa10.55□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 IGLC3P0DOY3 106 aa10.55□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa10.55□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 K7EQD1 137 aa10.55□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 TMEM14CQ9P0S9 112 aa10.55□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 H0Y9J4 135 aa10.54□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 MAJINQ3KP22 176 aa10.54□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 GAGE12HA6NDE8 117 aa10.54□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 H3BMG7 143 aa10.54□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 Q6ZWC4 215 aa10.54□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 C20orf78Q9BR46 151 aa10.54□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 H3BUA1 57 aa10.54□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 IGLC1P0CG04 106 aa10.54□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 NREPQ16612 68 aa10.54□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 DKK2Q9UBU2 259 aa10.54□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 PLA2G5P39877 138 aa10.54□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 LINC00311Q8N616 119 aa10.53□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 SHANK1Q9Y566 2161 aa10.53□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 LGALS9BQ3B8N2 356 aa10.53□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 LGALS9CQ6DKI2 356 aa10.53□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa10.53□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 IGLV1-44P01699 117 aa10.53□□□□□ -0.72
TMX4-201ENST00000246024 F8W1H4 67 aa10.52□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 NDUFA1O15239 70 aa10.52□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 HERV-K104P63124 156 aa10.52□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 SH2D6Q7Z4S9 175 aa10.52□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa10.52□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa10.52□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa10.52□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 ZNF491Q8N8L2 437 aa10.52□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 ZFP2Q6ZN57 461 aa10.51□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 GTSF1Q8WW33 167 aa10.51□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 CUL9Q8IWT3 2517 aa10.51□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 HHLA3Q9XRX5 114 aa10.51□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 RITA1Q96K30 269 aa10.51□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 KLK12Q9UKR0 248 aa10.51□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 COX8AP10176 69 aa10.51□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 SVIPQ8NHG7 77 aa10.51□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 PTPN13Q12923 2485 aa10.5□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 PROP1O75360 226 aa10.5□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 CFC1BP0CG36 223 aa10.5□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 CFC1P0CG37 223 aa10.5□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 WFDC11Q8NEX6 87 aa10.5□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 RNF183Q96D59 192 aa10.5□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 FXYD5Q96DB9 178 aa10.5□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 AJUBAQ96IF1 538 aa10.5□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 SPATA25Q9BR10 227 aa10.5□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 V9GYV3 84 aa10.5□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 DOCK11Q5JSL3 2073 aa10.5□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 C19orf84I3L1E1 186 aa10.5□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 LTAP01374 205 aa10.5□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 SPANXA1Q9NS26 97 aa10.5□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.5□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 ZNF493Q6ZR52 646 aa10.49□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa10.49□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa10.49□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 IGHV2-70P01814 119 aa10.49□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 NACAE9PAV3 2078 aa10.49□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 IGKV4-1P06312 121 aa10.49□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa10.49□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 IGLL1P15814 213 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 A0A1W2PPM0 123 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 C15orf65H3BRN8 121 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 K7EP34 96 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 Q8NFD4 153 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 MED13Q9UHV7 2174 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 A0A087WW49 117 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 A0A096LNI7 61 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 PRR20EP86478 221 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 PRR20CP86479 221 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 PRR20DP86480 221 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 PRR20BP86481 221 aa10.48□□□□□ -0.73
TMX4-201ENST00000246024 PRR20AP86496 221 aa10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms