RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF815PA8K554 130 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 RNF223E7ERA6 249 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 ARL3P36405 182 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 LMO4P61968 165 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa20.48■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 F6UB75 175 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 VPS13CQ709C8 3753 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 SCGB1D4Q6XE38 83 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 DPH3P1Q9H4G8 78 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 LINC00477Q96M19 166 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 LENEPQ9Y5L5 61 aa20.47■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 GNRH2O43555 120 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 SLC25A16P16260 332 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 MUC4Q99102 2169 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 OR10J6PQ8NGY7 276 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM149A-201ENST00000227065 TRAV21A0A0B4J279 112 aa20.45■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 KLRB1Q12918 225 aa20.45■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 LINC01549A6NIU2 74 aa20.45■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 CIDEAO60543 219 aa20.45■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 SPATA25Q9BR10 227 aa20.45■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 ASIPP42127 132 aa20.44■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 RPL11P62913 178 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 CLEC2AQ6UVW9 174 aa20.44■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 SPOCK3Q9BQ16 436 aa20.44■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 C20orf78Q9BR46 151 aa20.43■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 NDUFS8O00217 210 aa20.42■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 FAM223BA6NKX1 122 aa20.42■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 APOMO95445 188 aa20.42■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 FAM223AQ8IWN6 122 aa20.42■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa20.41■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 LINC01619G3V211 115 aa20.41■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 ARL17AQ8IVW1 177 aa20.41■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 MOB4Q9Y3A3 225 aa20.41■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 C19orf54Q5BKX5 351 aa20.41■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 ZFP2Q6ZN57 461 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 SOCS3O14543 225 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 OVOL1O14753 267 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 IGHV3-11P01762 117 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 BRD3OSQ6XYD6 125 aa20.4■□□□□ 0.86
FAM149A-201ENST00000227065 CRYGDP07320 174 aa20.39■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 SCGB1A1P11684 91 aa20.39■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 C11orf86A6NJI1 115 aa20.38■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 COX6B1P14854 86 aa20.38■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 PSMB2P49721 201 aa20.38■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 JPT2Q9H910 190 aa20.38■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 TSPAN13O95857 204 aa20.37■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa20.37■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 PTH2Q96A98 100 aa20.37■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 TSHBP01222 138 aa20.36■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 CFAP126Q5VTH2 177 aa20.36■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 WFDC12Q8WWY7 111 aa20.36■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 NDUFA4O00483 81 aa20.36■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 RPL39P62891 51 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa20.36■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 ATP6V0BQ99437 205 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 NFE4Q86UQ8 179 aa20.35■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 SRD5A1P18405 259 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 UBE2D1P51668 147 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 FOXI1Q12951 378 aa20.34■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 A6NJY4 79 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 TGFAP01135 160 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 LY6EQ16553 131 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 FAM19A4Q96LR4 140 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 SYT8Q8NBV8 401 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 ABCA2Q9BZC7 2435 aa20.33■□□□□ 0.85
FAM149A-201ENST00000227065 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa20.33■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 Q6ZS46 218 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 CD7P09564 240 aa20.32■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 A0A087WWL8 130 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 TSPEAR-AS2P59090 65 aa20.31■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa20.3■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa20.29■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 A0A0J9YY99 117 aa20.29■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 IGHV1-69P01742 117 aa20.29■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 MED14OSP0DP75 135 aa20.29■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 LINC00315P59091 139 aa20.29■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 FHL3Q13643 280 aa20.29■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 A0A1B0GV72 72 aa20.28■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 PF4V1P10720 104 aa20.28■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM170BQ5T4T1 132 aa20.28■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa20.28■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 F5H697 171 aa20.27■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 EDN2P20800 178 aa20.27■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 NDUFA11Q86Y39 141 aa20.27■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 APRG1Q8IVJ8 170 aa20.27■□□□□ 0.84
FAM149A-201ENST00000227065 IGIPA6NJ69 53 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms