RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000198767.10

RRN3-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3, Length 3,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-201ENST00000198767 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.76□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 CKS1BP61024 79 aa6.76□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 CEND1Q8N111 149 aa6.76□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 ZNF502Q8TBZ5 544 aa6.76□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.76□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 GATA3P23771 443 aa6.75□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 PSMB2P49721 201 aa6.75□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.75□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 Q6ZS46 218 aa6.75□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 ODF3BA8MYP8 253 aa6.75□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 OOSP1A8MZH6 123 aa6.75□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 DPM2O94777 84 aa6.75□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.75□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 GAGE13Q4V321 117 aa6.75□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.75□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.75□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 SYT8Q8NBV8 401 aa6.75□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 DUX3Q96PT4 197 aa6.75□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.75□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 PRSS47A8MTI9 375 aa6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 TRBV12-3P01733 135 aa6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 CRYGBP07316 175 aa6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 MGPP08493 103 aa6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 PAX8Q06710 450 aa6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 ZNF575Q86XF7 245 aa6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 DPF1Q92782 380 aa6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.74□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 LINC01549A6NIU2 74 aa6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 MT-ATP8P03928 68 aa6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 CTSGP08311 255 aa6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 NPBQ8NG41 125 aa6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 NDUFS8O00217 210 aa6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 TTC9CQ8N5M4 171 aa6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 ATP6V0BQ99437 205 aa6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 KIR2DL4Q99706 377 aa6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.73□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.72□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.72□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.72□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 IGHG4P01861 327 aa6.72□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.72□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 U3KQK5 164 aa6.72□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 VPS13CQ709C8 3753 aa6.72□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 CRYBA4P53673 196 aa6.72□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 DEFB136Q30KP8 78 aa6.72□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.72□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.72□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 E9PLD3 99 aa6.71□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 SLC25A16P16260 332 aa6.71□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 FHL3Q13643 280 aa6.71□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
RRN3-201ENST00000198767 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.71□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 F8W735 103 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 J3QKU1 62 aa6.71□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 Q6AWC8 147 aa6.71□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 NFE4Q86UQ8 179 aa6.71□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 OR11H12B2RN74 326 aa6.71□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 SPINK8P0C7L1 97 aa6.71□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 OR11H1Q8NG94 326 aa6.71□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 OR11H2Q8NH07 326 aa6.71□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.71□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 ATRQ13535 2644 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 A0A1B0GV72 72 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 F6UB75 175 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 IGLC6P0CF74 106 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 ZNF815PA8K554 130 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 SYNJ2BPP57105 145 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 RRN3P1Q2M238 152 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 RAX2Q96IS3 184 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 NF1P21359 2839 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 A0A1B0GW15 77 aa6.7□□□□□ -1.34
RRN3-201ENST00000198767 J3QR89 54 aa6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.4 ms