RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599939.1

TIMM44-210, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 44, humanhuman

Gene TIMM44, Length 2,227 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM44-210ENST00000599939 CCL19Q99731 98 aa15.25■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 A6NDX4 124 aa15.25■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 BRI3O95415 125 aa15.25■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 IGKCP01834 107 aa15.25■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 LAGE3Q14657 143 aa15.25■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 USMG5Q96IX5 58 aa15.25■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 CFAP46Q8IYW2 2715 aa15.25■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 H3BUA1 57 aa15.24■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 RBX1P62877 108 aa15.24■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 Q6ZS46 218 aa15.24■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 OR10J6PQ8NGY7 276 aa15.24■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.031e-13■■■■□ 20.7
TIMM44-210ENST00000599939 OVOL1O14753 267 aa15.24■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 BLCAPP62952 87 aa15.24■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 A6NDN8 102 aa15.23■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 ATP5LO75964 103 aa15.23■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 LCNL1Q6ZST4 164 aa15.23■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 TTTY13Q9BZ97 58 aa15.23■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 SPRY2O43597 315 aa15.23■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 MRAP2Q96G30 205 aa15.23■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa15.22■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 TRAV21A0A0B4J279 112 aa15.22■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 DPM2O94777 84 aa15.22■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 PF4V1P10720 104 aa15.22■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 FAM19A4Q96LR4 140 aa15.22■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 SMPXQ9UHP9 88 aa15.22■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 TMEM8BA6NDV4 472 aa15.21■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 F6UB75 175 aa15.21■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 H3BRM9 83 aa15.21■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 KIR3DS1Q14943 382 aa15.21■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 PSMG4Q5JS54 123 aa15.21■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 M0R381 172 aa15.21■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 RPL11P62913 178 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
TIMM44-210ENST00000599939 CSPG4Q6UVK1 2322 aa15.2■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 NDUFS8O00217 210 aa15.2■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 CLEC2AQ6UVW9 174 aa15.2■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 GTSCR1Q86UQ5 136 aa15.2■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 JMJD8Q96S16 334 aa15.2■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 SMIM2Q9BVW6 85 aa15.2■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 C9orf118A6NHY6 69 aa15.2■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa15.2■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa15.2■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 MYOZ3Q8TDC0 251 aa15.2■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 FLNCQ14315 2725 aa15.19■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa15.19■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 ATP5J2P56134 94 aa15.19■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP15.19■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 TM4SF20Q53R12 229 aa15.19■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 SELENOKQ9Y6D0 94 aa15.19■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 IGLV1-40P01703 118 aa15.19■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 ASIPP42127 132 aa15.19■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa15.19■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 MSMBP08118 114 aa15.18■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 S100A4P26447 101 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 APRG1Q8IVJ8 170 aa15.18■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 RASL10AQ92737 203 aa15.18■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 TMEM160Q9NX00 188 aa15.18■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa15.18■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 CST9LQ9H4G1 147 aa15.17■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 HIGD1BQ9P298 99 aa15.17■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 MUC4Q99102 2169 aa15.17■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 DPH3P1Q9H4G8 78 aa15.17■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa15.17■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 A0A087WX48 190 aa15.16■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 H3BUT2 72 aa15.16■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 CFHR3Q02985 330 aa15.16■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 SPOCK3Q9BQ16 436 aa15.16■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa15.16■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 AVPP01185 164 aa15.16■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 EDN2P20800 178 aa15.16■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 UFSP1Q6NVU6 142 aa15.16■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 A0A0G2JLM5 398 aa15.15■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 GAGE12BA1L429 117 aa15.15■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 GAGE10A6NGK3 116 aa15.15■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 GNRH2O43555 120 aa15.15■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 MED14OSP0DP75 135 aa15.15■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 AP1S3Q96PC3 154 aa15.15■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 CHAC1Q9BUX1 264 aa15.15■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa15.15■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 RAB37Q96AX2 223 aa15.15■□□□□ 0.02
TIMM44-210ENST00000599939 RNF223E7ERA6 249 aa15.14■□□□□ 0.01
TIMM44-210ENST00000599939 HLA-DRB4P13762 266 aa15.14■□□□□ 0.01
TIMM44-210ENST00000599939 SRD5A1P18405 259 aa15.14■□□□□ 0.01
TIMM44-210ENST00000599939 CDKN1BP46527 198 aa15.14■□□□□ 0.01
TIMM44-210ENST00000599939 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa15.14■□□□□ 0.01
TIMM44-210ENST00000599939 PIEZO1Q92508 2521 aa15.14■□□□□ 0.01
TIMM44-210ENST00000599939 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa15.13■□□□□ 0.01
TIMM44-210ENST00000599939 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
TIMM44-210ENST00000599939 FXYD2P54710 66 aa15.13■□□□□ 0.01
TIMM44-210ENST00000599939 TMEM95Q3KNT9 176 aa15.13■□□□□ 0.01
TIMM44-210ENST00000599939 C20orf78Q9BR46 151 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.8 ms