RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584377.5

CSNK1D-222, Transcript of casein kinase 1 delta, human

TSL 2

Gene CSNK1D, Length 2,891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK1D-222	ENST00000584377	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		10.15	□□□□□ -0.78
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		10.15	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	CKS2	P33552	79 aa		10.15	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	PIFO	Q8TCI5	191 aa		10.15	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	VPS13C	Q709C8	3753 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377		H3BMG7	143 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZFHX3	Q15911	3703 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	SMKR1	H3BMG3	65 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	LINC01559	Q495D7	138 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		10.14	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM223B	A6NKX1	122 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377		E9PLD3	99 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	TSPAN13	O95857	204 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRGV3	P03979	118 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	CCL19	Q99731	98 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	CNFN	Q9BYD5	112 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	NPY	P01303	97 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377		U3KQE9	123 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	SPG11	Q96JI7	2443 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	FXYD7	P58549	80 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	C20orf78	Q9BR46	151 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	HIGD1B	Q9P298	99 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGLL5	B9A064	214 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	ARL3	P36405	182 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377		K7EMI3	77 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	GATA3	P23771	443 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	LY6E	Q16553	131 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	GAGE13	Q4V321	117 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	AMTN	Q6UX39	209 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	RNF185	Q96GF1	192 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	DKK2	Q9UBU2	259 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	PIEZO1	Q92508	2521 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	HBD	P02042	147 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	ZNF479	Q96JC4	524 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	C16orf92	Q96LL3	132 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	OR11H12	B2RN74	326 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	SPINK8	P0C7L1	97 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	OR11H1	Q8NG94	326 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	OR11H2	Q8NH07	326 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGF1	P05019	195 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	ATP5J2	P56134	94 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	PRO0461	Q9UI25	63 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRBV12-3	P01733	135 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	CEND1	Q8N111	149 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	GLMP	Q8WWB7	406 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	TM2D2	Q9BX73	214 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CSNK1D-222	ENST00000584377		H3BUX3	64 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	RNF183	Q96D59	192 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	CDIP1	Q9H305	208 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	GAS8-AS1	O95177	125 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	AGRN	O00468	2067 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	SYT8	Q8NBV8	401 aa		10.08	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377		A0A1B0GWB2	263 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	NDUFA4	O00483	81 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	MT-ATP8	P03928	68 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	FLNC	Q14315	2725 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	TNFRSF6B	O95407	300 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	APOM	O95445	188 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGHV3-11	P01762	117 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	IGHG2	P01859	326 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	ERG28	Q9UKR5	140 aa		10.07	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	MSMB	P08118	114 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	EVI2A	P22794	236 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		10.06	□□□□□ -0.8
CSNK1D-222	ENST00000584377		Q6ZQT7	251 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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