RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		14	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		14	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0G2JLM5	398 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV12-3	P01733	135 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	MED14OS	P0DP75	135 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-DRB4	P13762	266 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	CCL19	Q99731	98 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559		A6NDX4	124 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	RBX1	P62877	108 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		13.99	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559		K7EMI3	77 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ASIP	P42127	132 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559		Q6ZQT7	251 aa		13.98	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	GAGE10	A6NGK3	116 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559		H3BUX3	64 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	LY6E	Q16553	131 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	CDKN1B	P46527	198 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	C20orf78	Q9BR46	151 aa		13.97	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PF4V1	P10720	104 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PLN	P26678	52 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		13.96	□□□□□ -0.17
RRN3-205	ENST00000563559		A0A087WX48	190 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	GAGE12B	A1L429	117 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	CST9L	Q9H4G1	147 aa		13.96	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A16	P16260	332 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		13.95	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559		J3KRW8	73 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559		M0R381	172 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	PPP1R17	O96001	155 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV3-11	P01762	117 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM160	Q9NX00	188 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	IGLV1-40	P01703	118 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	MSMB	P08118	114 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	KLK15	Q9H2R5	256 aa		13.94	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	ATP5J2	P56134	94 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559		H3BUT2	72 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		13.93	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM13	P0DJ93	91 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	BLCAP	P62952	87 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF580	Q9UK33	172 aa		13.92	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559		H7C1H1	209 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559		K7EMT4	169 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	RASL10A	Q92737	203 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559		K7EP34	96 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	ID1	P41134	155 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	TM4SF20	Q53R12	229 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	TOMM6	Q96B49	74 aa		13.91	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	GCSH	P23434	173 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559		F8VRH5	84 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		13.9	□□□□□ -0.18
RRN3-205	ENST00000563559	CFHR3	Q02985	330 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	JMJD8	Q96S16	334 aa		13.89	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PPM0	123 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559		B4DSR2	109 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559		K7ERU9	68 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	GATA3	P23771	443 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	PCP4	P48539	62 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	RAB37	Q96AX2	223 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	TM2D2	Q9BX73	214 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559		F6UB75	175 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	NXPH4	O95158	308 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	DEFB1	P60022	68 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	TAL2	Q16559	108 aa		13.88	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	FABP2	P12104	132 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		13.87	□□□□□ -0.19
RRN3-205	ENST00000563559	KLLN	B2CW77	178 aa		13.87	□□□□□ -0.19

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