RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 Q8N2B8 174 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 UPK3BQ9BT76 320 aa4.12□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 FER1L5A0AVI2 2057 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 DYSFO75923 2080 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 K7ERJ3 54 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 MGST3O14880 152 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IGKV1-5P01602 117 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 HBDP02042 147 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 COX8AP10176 69 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 MFAP2P55001 183 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 KIAA0087Q14695 138 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 MIC13Q5XKP0 118 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 OR8B2Q96RD0 313 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 MGST2Q99735 147 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 DEFB126Q9BYW3 111 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 SLC25A22Q9H936 323 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa4.11□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 ATP6V0E1O15342 81 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 SERF1AO75920 110 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 NXPH4O95158 308 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 UBE2G1P62253 170 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 UBE2BP63146 152 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 CCL8P80075 99 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 SPANXN5Q5MJ07 72 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 Q6ZS52 159 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 Q6ZSV7 163 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF843Q8N446 348 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 ODF3Q96PU9 254 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 TXNDC17Q9BRA2 123 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.1□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 TRAV17A0A0B4J275 112 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 C11orf94C9JXX5 98 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IGLV2-14P01704 120 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 P0C879 139 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 CCL3P10147 92 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 NPPCP23582 126 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 GNB1P62873 340 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 SS18Q15532 418 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 TSKUQ8WUA8 353 aa4.09□□□□□ -1.75
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CAPN3-211ENST00000562199 LINC01600Q96MT4 127 aa4.09□□□□□ -1.75
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CAPN3-211ENST00000562199 PROK2Q9HC23 129 aa4.09□□□□□ -1.75
CAPN3-211ENST00000562199 IL36RNQ9UBH0 155 aa4.09□□□□□ -1.75
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CAPN3-211ENST00000562199 COX7A2P2O60397 106 aa4.08□□□□□ -1.76
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CAPN3-211ENST00000562199 PATE4P0C8F1 98 aa4.08□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 BRCA2P51587 3418 aa4.08□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF138P52744 262 aa4.08□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 LINC00205P59089 165 aa4.08□□□□□ -1.76
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CAPN3-211ENST00000562199 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 C5orf38Q86SI9 138 aa4.08□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 ALPK2Q86TB3 2170 aa4.08□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 MDP1Q86V88 176 aa4.08□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 GPHB5Q86YW7 130 aa4.08□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 HIST1H4GQ99525 98 aa4.08□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 IL36BQ9NZH7 164 aa4.08□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 EPDR1Q9UM22 224 aa4.08□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 LY96Q9Y6Y9 160 aa4.08□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 MYO7AQ13402 2215 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa4.07□□□□□ -1.76
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CAPN3-211ENST00000562199 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 CXCL6P80162 114 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
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CAPN3-211ENST00000562199 Q6P435 159 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF497Q6ZNH5 498 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 BAGE3Q86Y29 109 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 BAGE2Q86Y30 109 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 SERP2Q8N6R1 65 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF645Q8N7E2 425 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 Q8N7P7 452 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 C11orf52Q96A22 123 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 TRGV9Q99603 122 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM243Q9BU79 118 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 CLEC7AQ9BXN2 247 aa4.07□□□□□ -1.76
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF702PQ9H963 129 aa4.07□□□□□ -1.76
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