RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559312.5

NUMB-231, Transcript of NUMB, endocytic adaptor protein, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUMB, Length 1,439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUMB-231	ENST00000559312	FAM210A	Q96ND0	272 aa		5.44	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		5.44	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	XCL2	Q9UBD3	114 aa		5.44	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	PSG8	Q9UQ74	426 aa		5.44	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM250	H0YL14	139 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	AKR1C3	P42330	323 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	PCP4	P48539	62 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	FXYD7	P58549	80 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	UBE2G1	P62253	170 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	IFITM2	Q01629	132 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	RARRES2	Q99969	163 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TREM1	Q9NP99	234 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		5.43	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	C7orf71	A4D174	169 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312		H7BYZ3	331 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	MIF	P14174	115 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TAS2R60	P59551	318 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	CLLU1	Q5K131	121 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312		Q6AWC8	147 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	PRNT	Q86SH4	94 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312		Q86TA4	180 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	OR11H2	Q8NH07	326 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	SGK494	Q96LW2	274 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00479	Q96M42	142 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	LTA	P01374	205 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	BTN1A1	Q13410	526 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	SMUG1	Q53HV7	270 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TVP23C	Q96ET8	276 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	SMIM12	Q96EX1	92 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	LINC01587	Q99440	93 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	RETN	Q9HD89	108 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	MED9	Q9NWA0	146 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312		U3KQK5	164 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TENM3	Q9P273	2699 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TG	P01266	2768 aa		5.41	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM189	A5PLL7	270 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312		J3KRW8	73 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	GCG	P01275	180 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	RRN3P1	Q2M238	152 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	PRR9	Q5T870	116 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312		Q8NAQ8	132 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NUMB-231	ENST00000559312		C9JCJ5	164 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	ATP6V1G1	O75348	118 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	GNG4	P50150	75 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	PEA15	Q15121	130 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	TDRG1	Q3Y452	100 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	BAGE2	Q86Y30	109 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	C16orf74	Q96GX8	76 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	DERL1	Q9BUN8	251 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	RAB19	A4D1S5	217 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	CENPW	Q5EE01	88 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	KCNS1	Q96KK3	526 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	PARL	Q9H300	379 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	BIN3	Q9NQY0	253 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NUMB-231	ENST00000559312		A0A0J9YWU9	116 aa		5.38	□□□□□ -1.55

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