RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557130.1

UBE2CP1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP1, Length 554 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP1-201ENST00000557130 NRACQ8N912 160 aa5.84□□□□□ -1.47
UBE2CP1-201ENST00000557130 C20orf173Q96LM9 149 aa5.84□□□□□ -1.47
UBE2CP1-201ENST00000557130 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
UBE2CP1-201ENST00000557130 LINC00527Q9UJ94 153 aa5.84□□□□□ -1.47
UBE2CP1-201ENST00000557130 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 LINC01549A6NIU2 74 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 FAM229AH3BQW9 127 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 K7EP13 123 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 M0R381 172 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 CCL25O15444 150 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 PRSS1P07477 247 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 SMIM17P0DL12 118 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 HLA-DRB4P13762 266 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 ASIPP42127 132 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 LY6EQ16553 131 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 POM121L12Q8N7R1 296 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 KLK15Q9H2R5 256 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 HIGD1BQ9P298 99 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa5.83□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 A6NDN8 102 aa5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 H3BRM9 83 aa5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 DPM2O94777 84 aa5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRBV12-3P01733 135 aa5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 HSD52Q0P140 79 aa5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 ODF1Q14990 250 aa5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 VAMP3Q15836 100 aa5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 ORMDL2Q53FV1 153 aa5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 ODF3Q96PU9 254 aa5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 DKK2Q9UBU2 259 aa5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 SPTBN4Q9H254 2564 aa5.82□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.81□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 A0A087WW49 117 aa5.81□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 A0A087WX48 190 aa5.81□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.81□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 GAS8-AS1O95177 125 aa5.81□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 IGKCP01834 107 aa5.81□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 FXYD7P58549 80 aa5.81□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 TM4SF20Q53R12 229 aa5.81□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.81□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.81□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 KLLNB2CW77 178 aa5.8□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 H3BVH4 76 aa5.8□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 NXPH4O95158 308 aa5.8□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 IGHV3-11P01762 117 aa5.8□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 PSMB8P28062 276 aa5.8□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.8□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 PRR9Q5T870 116 aa5.8□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.8□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 Q6ZS46 218 aa5.8□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 RNF152Q8N8N0 203 aa5.8□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 C18orf15Q96N68 181 aa5.8□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 SMIM2Q9BVW6 85 aa5.8□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 C7orf71A4D174 169 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 C9orf118A6NHY6 69 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 H7C1H1 209 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 LGALS9O00182 355 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 ELANEP08246 267 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 PLNP26678 52 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 TAL2Q16559 108 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 Q6ZQT7 251 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 Q6ZVH6 145 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 RASL10AQ92737 203 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 TOMM6Q96B49 74 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 FOXC2Q99958 501 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 CACNA1BQ00975 2339 aa5.79□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 CBY3A6NI87 242 aa5.78□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 GNRH2O43555 120 aa5.78□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 NMUP48645 174 aa5.78□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 DEFB112Q30KQ8 113 aa5.78□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 SHISA2Q6UWI4 295 aa5.78□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 FAM159AQ6UWV7 190 aa5.78□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.78□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 PCP2Q8IVA1 136 aa5.78□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 DCANP1Q8TF63 244 aa5.78□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 AP1S3Q96PC3 154 aa5.78□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 SCGB3A1Q96QR1 104 aa5.78□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.78□□□□□ -1.48
UBE2CP1-201ENST00000557130 NCOR2Q9Y618 2525 aa5.77□□□□□ -1.49
UBE2CP1-201ENST00000557130 A0A096LNT2 108 aa5.77□□□□□ -1.49
UBE2CP1-201ENST00000557130 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms