RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 GAGE2EQ4V326 116 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-204ENST00000538708 HIST1H2BJP06899 126 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRB-204ENST00000538708 C14orf177Q52M58 125 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-204ENST00000538708 IGLV1-47P01700 117 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRB-204ENST00000538708 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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