RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538258.1

PGA3-204, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PGA3, Length 867 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-204ENST00000538258 PDE6HQ13956 83 aa6.6□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 ADIRFQ15847 76 aa6.6□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 ZNF726P1Q15940 193 aa6.6□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 COX19Q49B96 90 aa6.6□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 SSX7Q7RTT5 188 aa6.6□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.6□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.6□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.6□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.6□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 IL17DQ8TAD2 202 aa6.6□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa6.59□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 C20orf202A1L168 122 aa6.59□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 NDUFB4O95168 129 aa6.59□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.59□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 AMTNQ6UX39 209 aa6.59□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.59□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 FXYD5Q96DB9 178 aa6.59□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 VAMP8Q9BV40 100 aa6.59□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.59□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.59□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.59□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PGA3-204ENST00000538258 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 PRAC2D3DTV9 90 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 M0R2Z0 102 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 M0R3E3 92 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 DEFB4AO15263 64 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 PDE6DO43924 150 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 MIFP14174 115 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 UBE2V1Q13404 147 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 OR5I1Q13606 314 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 LINC01551Q86U37 167 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 ZNF503Q96F45 646 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 PARLQ9H300 379 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 X6R8D5 127 aa6.58□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 INSP01308 110 aa6.57□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 CTRLP40313 264 aa6.57□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 CASC10Q5T4H9 136 aa6.57□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.57□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.57□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 Q8NAQ8 132 aa6.57□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.57□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.57□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.56□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.56□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.56□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.56□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 TSPOP30536 169 aa6.56□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 CSN1S1P47710 185 aa6.56□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 UBE2G2P60604 165 aa6.56□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 PET117Q6UWS5 81 aa6.56□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.56□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.56□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 Q9H3A6 140 aa6.56□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 SMIM9A6NGZ8 99 aa6.55□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 MT-ND6P03923 174 aa6.55□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 STAG3L2P0CL84 134 aa6.55□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 STAG3L3P0CL85 134 aa6.55□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 CT45A10P0DMU9 189 aa6.55□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 LEPP41159 167 aa6.55□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 PTTG1IPP53801 180 aa6.55□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 ERCC8Q13216 396 aa6.55□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.55□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.55□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 LINC00477Q96M19 166 aa6.55□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 PGPA6NDG6 321 aa6.54□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 J3KRW8 73 aa6.54□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 CXorf1O96002 111 aa6.54□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 IGLC3P0DOY3 106 aa6.54□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 CRISP2P16562 243 aa6.54□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 GCHFRP30047 84 aa6.54□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 RRN3P1Q2M238 152 aa6.54□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.54□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.54□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 ODF3Q96PU9 254 aa6.54□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.54□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.54□□□□□ -1.36
PGA3-204ENST00000538258 OTORQ9NRC9 128 aa6.54□□□□□ -1.36
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