RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526550.1

PTPRJ-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRJ, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-203ENST00000526550 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 PGPA6NDG6 321 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 IGHV3-30P01768 117 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 IGHV3-33P01772 117 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 OR10J3Q5JRS4 329 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 FAM74A1Q5RGS3 127 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 Q6ZSN1 163 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 SH2D6Q7Z4S9 175 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 OTORQ9NRC9 128 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 LENEPQ9Y5L5 61 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 A0A1W2PPV4 95 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 H0YIZ8 118 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 TYMSP04818 313 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 GNG5P63218 68 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 CYCSP99999 105 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 ASAH1Q13510 395 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 PRADC1Q9BSG0 188 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 NDFIP1Q9BT67 221 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 TREM1Q9NP99 234 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 MBD2Q9UBB5 411 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 HERC1Q15751 4861 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 SSNA1O43805 119 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 PFN1P07737 140 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 PET100P0DJ07 73 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 TDRG1Q3Y452 100 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 ZNF876PQ49A33 203 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 LINC01556Q5JQF7 62 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 Q8N814 137 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 TMED6Q8WW62 240 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 ASB13Q8WXK3 278 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 KCNS1Q96KK3 526 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 SGK494Q96LW2 274 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 TMEM70Q9BUB7 260 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 NDUFA13Q9P0J0 144 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 HSPB11Q9Y547 144 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 RPL12P30050 165 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 TIRAPP58753 221 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 RAB2AP61019 212 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 RHOHQ15669 191 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 S100ZQ8WXG8 99 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-203ENST00000526550 LECT2O14960 151 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 RS1O15537 224 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 MPC2O95563 127 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 H2BFSP57053 126 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 ZFP69Q49AA0 526 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 LELP1Q5T871 98 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 OR10G9Q8NGN4 311 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 TVP23CQ96ET8 276 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 TM2D2Q9BX73 214 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 FAT1Q14517 4588 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 GAGE12JA6NER3 117 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 K7EQM0 130 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 TAAR5O14804 337 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 UPK1BO75841 260 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 GCGP01275 180 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 ARL14EPLP0DKL9 152 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 GAGE1Q13065 139 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 GAGE4Q13068 117 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 GAGE5Q13069 117 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 LINC01559Q495D7 138 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 GAGE13Q4V321 117 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 ZNF506Q5JVG8 444 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 DPPA3Q6W0C5 159 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 PRNTQ86SH4 94 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 WFDC1Q9HC57 220 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 PSG8Q9UQ74 426 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-203ENST00000526550 PGPEP1LA6NFU8 196 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.5 ms