RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 GCGP01275 180 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 SFTA3P0C7M3 94 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 LGALS9BQ3B8N2 356 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 Q86TA4 180 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 NDFIP1Q9BT67 221 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PKHD1P08F94 4074 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1B0GV50 99 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 K7EQM0 130 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 PEX7O00628 323 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A096LPF7 62 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A0D9SG52 128 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 IFNA7P01567 189 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 TMUB2Q71RG4 321 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM213BQ8TBF2 198 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF479Q96JC4 524 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 SDF2L1Q9HCN8 221 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BNG1 76 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 SEC11BP0C7V7 166 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CCL18P55774 89 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 FHL2Q14192 279 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ESRGQ1W209 222 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 PFN1P07737 140 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFP69Q49AA0 526 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 SMUG1Q53HV7 270 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 Q6ZNX1 250 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 RASL10AQ92737 203 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1B0GVY2 172 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 PFDN1O60925 122 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CRYBA4P53673 196 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 SPXQ9BT56 116 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 TCTE3Q8IZS6 198 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 PRSS29PA6NIE9 313 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 M0R2P5 195 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 PAX4O43316 350 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 PAGE4O60829 102 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CST9LP1Q5W188 147 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 STOML3Q8TAV4 291 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 SFT2D1Q8WV19 159 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 HIST1H2BAQ96A08 127 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNS1Q96KK3 526 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 PRO0255Q9UI72 69 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAV4A0A0B4J268 109 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 UMAD1C9J7I0 102 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 TPT1P13693 172 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 DPPA3Q6W0C5 159 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 LINC00336Q6ZUF6 198 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 MBD3L1Q8WWY6 194 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 C9orf85Q96MD7 179 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ICOSQ9Y6W8 199 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PPT1P50897 306 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 UPK3BQ9BT76 320 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 HHLA3Q9XRX5 114 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAH11Q96DT5 4516 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 SCO2A0A1W2PP80 73 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 C9JCJ5 164 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CRIP1P50238 77 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf134Q5TEV5 83 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 NHLRC2Q8NBF2 726 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 Q9H8V8 135 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 K7EQD1 137 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 AKR1C3P42330 323 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF506Q5JVG8 444 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 OR4C5Q8NGB2 326 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 FMC1Q96HJ9 113 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 KIAA1109Q2LD37 5005 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 PGPEP1LA6NFU8 196 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 SH2D1AO60880 128 aa12.85□□□□□ -0.35
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SH3BP2-218ENST00000511185 C1QBP02746 253 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 H2AFB1P0C5Y9 115 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 UBE2G1P62253 170 aa12.85□□□□□ -0.35
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SH3BP2-218ENST00000511185 GYPEP15421 78 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 CCL20P78556 96 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF876PQ49A33 203 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 TCEAL7Q9BRU2 100 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-218ENST00000511185 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 H3BVH4 76 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 CFAP126Q5VTH2 177 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 C6orf223Q8N319 242 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP2-218ENST00000511185 B4DEV8 164 aa12.82□□□□□ -0.36
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