RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497977.1

PTPRN-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-218ENST00000497977 GAGE12BA1L429 117 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRN-218ENST00000497977 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRN-218ENST00000497977 GAGE7O76087 117 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRN-218ENST00000497977 GAGE12FP0CL80 117 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRN-218ENST00000497977 GAGE12GP0CL81 117 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRN-218ENST00000497977 GAGE12IP0CL82 117 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRN-218ENST00000497977 OR5I1Q13606 314 aa7.38□□□□□ -1.23
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PTPRN-218ENST00000497977 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRN-218ENST00000497977 ZNF727A8MUV8 499 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRN-218ENST00000497977 PTH2Q96A98 100 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRN-218ENST00000497977 SFTA3P0C7M3 94 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRN-218ENST00000497977 ASIPP42127 132 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRN-218ENST00000497977 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRN-218ENST00000497977 ZNF876PQ49A33 203 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRN-218ENST00000497977 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.3□□□□□ -1.24
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