RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495426.1

BBS9-213, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 9, human

TSL 3

Gene BBS9, Length 481 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS9-213	ENST00000495426	LECT2	O14960	151 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	MCFD2	Q8NI22	146 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	SMIM8	Q96KF7	97 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	SOST	Q9BQB4	213 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	SRR	Q9GZT4	340 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.74	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	RS1	O15537	224 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	NMB	P08949	121 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	LAGE3	Q14657	143 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	SPCS2	Q15005	226 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	MUC21	Q5SSG8	566 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	PRELID1	Q9Y255	219 aa		4.73	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	TSC22D2	O75157	780 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	PYY	P10082	97 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	CAMLG	P49069	296 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	PDE6H	Q13956	83 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM183B	Q1AE95	376 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426		Q6ZRG5	221 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426		Q8TAT8	98 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	RASL10A	Q92737	203 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	PFDN5	Q99471	154 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	SPX	Q9BT56	116 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.72	□□□□□ -1.65
BBS9-213	ENST00000495426	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	TAS2R30	P59541	319 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	AP3S2	P59780	193 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	ASAH1	Q13510	395 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	GGACT	Q9BVM4	153 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.71	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	C9orf170	A2RU37	121 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	FABP12	A6NFH5	140 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF138	P52744	262 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	RAB31	Q13636	194 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	LELP1	Q5T871	98 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	NAGK	Q9UJ70	344 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.7	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426		M0R2P5	195 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	BAX	Q07812	192 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	ZNF266	Q14584	549 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	RHOH	Q15669	191 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426		Q6AWC8	147 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS9-213	ENST00000495426		L7N2F9	121 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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