RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493152.6

SUCLA2-208, Transcript of succinate-CoA ligase ADP-forming beta subunit, human

TSL 3

Gene SUCLA2, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLA2-208	ENST00000493152	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	TSKU	Q8WUA8	353 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	C10orf82	Q8WW14	230 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	CLEC2B	Q92478	149 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	LINC00052	Q96N35	136 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	AMELY	Q99218	206 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	SEC11C	Q9BY50	192 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	DPY30	Q9C005	99 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	MRPL35	Q9NZE8	188 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	GNG8	Q9UK08	70 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152		V9GYV3	84 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	PTPRS	Q13332	1948 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	HECW1	Q76N89	1606 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	NEO1	Q92859	1461 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	DSPP	Q9NZW4	1301 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		0.34	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	COL4A5	P29400	1685 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	MUC5AC	P98088	5654 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	CD109	Q6YHK3	1445 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152		A0A087WSZ3	146 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152		A0A0J9YY99	117 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	C20orf202	A1L168	122 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	C9orf170	A2RU37	121 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	INE1	O15225	51 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	NDUFC1	O43677	76 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	SIX6	O95475	246 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	CYB5A	P00167	134 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	IGKV1-5	P01602	117 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	IGKC	P01834	107 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	CD3D	P04234	171 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	CSN2	P05814	226 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	CCK	P06307	115 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	MGP	P08493	103 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	CXCL1	P09341	107 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	COX6C	P09669	75 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	COX8A	P10176	69 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	CRYGA	P11844	174 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	CCL4	P13236	92 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	CYBA	P13498	195 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	SPINT3	P49223	89 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	GNG4	P50150	75 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	DEFA3	P59666	94 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	ERVS71-1	P61550	626 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	NPC2	P61916	151 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	PPP3R1	P63098	170 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	COX6A2	Q02221	97 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	EMX2	Q04743	252 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	KLKP1	Q107X0	134 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	KISS1	Q15726	138 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	PIGY	Q3MUY2	71 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	MORN2	Q502X0	79 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	SPINK9	Q5DT21	86 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152		Q5XG85	94 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	MIC13	Q5XKP0	118 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	XAF1	Q6GPH4	301 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152		Q6ZQT0	140 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152		Q86TA4	180 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	DIRC1	Q969H9	104 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	USMG5	Q96IX5	58 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	AMELX	Q99217	191 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	C12orf57	Q99622	126 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	GGACT	Q9BVM4	153 aa		0.33	□□□□□ -2.36
SUCLA2-208	ENST00000493152	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		0.33	□□□□□ -2.36

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