RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492717.1

DCTN1-222, Transcript of dynactin subunit 1, human

TSL 2

Gene DCTN1, Length 371 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCTN1-222	ENST00000492717	PSG3	Q16557	428 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717		Q86TA4	180 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A087WWC5	75 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717		F8W036	122 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	GCG	P01275	180 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	IGLL1	P15814	213 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	BMI1	P35226	326 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	ISOC2	Q96AB3	205 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC00479	Q96M42	142 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	SMIM7	Q9BQ49	75 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	MUC4	Q99102	2169 aa		4.18	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717		K7EQM0	130 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	CRISP2	P16562	243 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	INSL3	P51460	131 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	XG	P55808	180 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	RHEB	Q15382	184 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	AMTN	Q6UX39	209 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	SVBP	Q8N300	66 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	ODF3	Q96PU9	254 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.17	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717		A0A0J9YX75	114 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF727	A8MUV8	499 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	KLLN	B2CW77	178 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717		B4DEV8	164 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717		K7EIL1	84 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	APOC3	P02656	99 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	AKR1C3	P42330	323 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	CRIP1	P50238	77 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	VGLL1	Q99990	258 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	VCX2	Q9H322	139 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	ZNF492	Q9P255	531 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.16	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.15	□□□□□ -1.74
DCTN1-222	ENST00000492717	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717	SNAPIN	O95295	136 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717	DEFB1	P60022	68 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717	PRR9	Q5T870	116 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717		Q6AWC8	147 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717	TUBA4B	Q9H853	241 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.15	□□□□□ -1.75
DCTN1-222	ENST00000492717		V9GYV3	84 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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