RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 MEOX2P50222 304 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 CNN1P51911 297 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 NDUFA5Q16718 116 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF674Q2M3X9 581 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 CENPWQ5EE01 88 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 ACTL10Q5JWF8 245 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 COX8CQ7Z4L0 72 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 PRNTQ86SH4 94 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 LINC01551Q86U37 167 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 DEFB125Q8N687 156 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 HIST1H2BAQ96A08 127 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 TXNDC17Q9BRA2 123 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 SMDT1Q9H4I9 107 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 SDF2L1Q9HCN8 221 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF492Q9P255 531 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 RNF24Q9Y225 148 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 PRELID1Q9Y255 219 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-212ENST00000491266 RBAKDNA6NC62 111 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 OR4C46A6NHA9 309 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 SCO1O75880 301 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 GCGP01275 180 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 IGKV3-20P01619 116 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 HLA-DRB4P13762 266 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 S100A7P31151 101 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 BMI1P35226 326 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 INSL3P51460 131 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 FXYD7P58549 80 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 TAS2R60P59551 318 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 SOHLH1Q5JUK2 328 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 FOXI2Q6ZQN5 318 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 BAGE2Q86Y30 109 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 SEC11CQ9BY50 192 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF727A8MUV8 499 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 KLLNB2CW77 178 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 C9JCJ5 164 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 F8W036 122 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 M0R2Z0 102 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 CRISP2P16562 243 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 ID1P41134 155 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF138P52744 262 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 BTN1A1Q13410 526 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM241Q24JQ0 296 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM183AQ8IXX5 376 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 CMTM2Q8TAZ6 248 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 ISOC2Q96AB3 205 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 FMC1Q96HJ9 113 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 AGRNO00468 2067 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 OR11H12B2RN74 326 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 K7EIL1 84 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 APOC3P02656 99 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 PAFAH1B2P68402 229 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 RPL19P84098 196 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 GFI1BQ5VTD9 330 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 Q75L30 129 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 OR4B1Q8NGF8 309 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 LINC00477Q96M19 166 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 YPEL4Q96NS1 127 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 CLEC5AQ9NY25 188 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 NAT8Q9UHE5 227 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 V9GYV3 84 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 C7orf77A4D0Y5 90 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 KRBOX1C9JBD0 128 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 SH2D1AO60880 128 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 CA1P00915 261 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 GZMBP10144 247 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 CSN1S1P47710 185 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 GNG4P50150 75 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 RNF212Q495C1 297 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms