RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 GZMBP10144 247 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 COX19Q49B96 90 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00467Q9BRT7 94 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 ANK2Q01484 3957 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 SNAI2O43623 268 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 LURAP1LQ8IV03 231 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 GATD1Q8NB37 220 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 KCNS1Q96KK3 526 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 PHOX2AO14813 284 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 INSP01308 110 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 OR5AL1P0C617 328 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 Q8N1Y9 231 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 MDFIQ99750 246 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 COL6A5A8TX70 2615 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 A0A1B0GUT8 65 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 A0A1B0GW15 77 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 F2Z2F3 143 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 MT-ND6P03923 174 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 HBBP68871 147 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 WDR73Q6P4I2 378 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf3-220ENST00000489318 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 NXPH4O95158 308 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 HLA-DQA1P01909 254 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 ASIPP42127 132 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 FXYD7P58549 80 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 MUC21Q5SSG8 566 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM256Q8N2U0 113 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 DEFB125Q8N687 156 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 NAGKQ9UJ70 344 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 SPINK4O60575 86 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 RIPPLY3P57055 190 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 RIGQ13278 110 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 BORCS7Q96B45 105 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 C9orf85Q96MD7 179 aa8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 SNURFLB1AK76 121 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 H3BVH4 76 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 TRGC2P03986 189 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 S100A8P05109 93 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 CACNG7P62955 275 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 C1orf196B1AJZ1 125 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 GNRH2O43555 120 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 KRTAP10-11P60412 298 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 TPPP3Q9BW30 176 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 XCL2Q9UBD3 114 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 A8MZ25 164 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 RAB5BP61020 215 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 C11orf72Q8NBR9 251 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 IL17DQ8TAD2 202 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
C9orf3-220ENST00000489318 MUC4Q99102 2169 aa8.34□□□□□ -1.07
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