RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 DIRC3C9JPN6 131 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 M0R2P5 195 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 GNRH2O43555 120 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 PPT1P50897 306 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 TDRG1Q3Y452 100 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 Q8N814 137 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 Q9HAA7 133 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 H0YIZ8 118 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 SIX6O95475 246 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 TMED6Q8WW62 240 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 HYLS1Q96M11 299 aa6.27□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 TYMSP04818 313 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 TVP23CQ96ET8 276 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 OTORQ9NRC9 128 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.26□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 F6UZH7 168 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 WFDC2Q14508 124 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 KHDC3LQ587J8 217 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP5SQ99766 215 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC32Q9BV29 185 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 NMES1Q9C002 83 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.25□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 TNXBP22105 4242 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 PGPA6NDG6 321 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-30P01768 117 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-33P01772 117 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 C1QBP02746 253 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 MT1HL1P0DM35 61 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 TAS2R45P59539 299 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF876PQ49A33 203 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 LELP1Q5T871 98 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZSA8 131 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 Q8N3U1 123 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 ASB13Q8WXK3 278 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 TREM1Q9NP99 234 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 MBD2Q9UBB5 411 aa6.24□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 RS1O15537 224 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 GNG5P63218 68 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 ASAH1Q13510 395 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 LAGE3Q14657 143 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 RHOHQ15669 191 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 SCXQ7RTU7 201 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 KCNS1Q96KK3 526 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.23□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 LECT2O14960 151 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 H2BFSP57053 126 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 SGK494Q96LW2 274 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 TM2D2Q9BX73 214 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 HSPB11Q9Y547 144 aa6.22□□□□□ -1.41
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB2AP61019 212 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-210ENST00000481231 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-210ENST00000481231 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-210ENST00000481231 ENKURQ8TC29 256 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-210ENST00000481231 C9orf85Q96MD7 179 aa6.21□□□□□ -1.42
SMARCE1-210ENST00000481231 WFDC1Q9HC57 220 aa6.21□□□□□ -1.42
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