RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474147.5

RBMS1-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 2

Gene RBMS1, Length 2,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-208	ENST00000474147		M0R3E3	92 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	TRIAP1	O43715	76 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	TNFRSF4	P43489	277 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	LCE2C	Q5TA81	110 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	AMELX	Q99217	191 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	UPK3B	Q9BT76	320 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	RNF186	Q9NXI6	227 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147		H3BT86	120 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	CGB3	P0DN86	165 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	CGB7	P0DN87	165 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	CD40	P25942	277 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	GUSBP11	Q6P575	273 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	RNF152	Q8N8N0	203 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	LY6L	H3BQJ8	138 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	LINC00643	Q86TS7	51 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	TMEM86B	Q8N661	226 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	TOMM6	Q96B49	74 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	KLK15	Q9H2R5	256 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	F5	P12259	2224 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	TMEM223	A0PJW6	202 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	RS1	O15537	224 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	SPRY2	O43597	315 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	TRGV3	P03979	118 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	COX6A1	P12074	109 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	CXCL5	P42830	114 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	ERCC8	Q13216	396 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	TRIO	O75962	3097 aa		3.37	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	IGKV1D-17	A0A075B6S4	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147		A0A1W2PR77	199 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	C11orf86	A6NJI1	115 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	ACYP1	P07311	99 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	LYZ	P61626	148 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147		J3QQQ9	107 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	PFN2	P35080	140 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	NXPH1	P58417	271 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147		Q1RN00	199 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	PMS2CL	Q68D20	193 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	PLXNB1	O43157	2135 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		3.36	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	ATOX1	O00244	68 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM27E3	Q08E93	113 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	PCOLCE	Q15113	449 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	HCP5	Q6MZN7	132 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	DCANP1	Q8TF63	244 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147		Q6ZT83	130 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147		Q8TAT8	98 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	CLEC2B	Q92478	149 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBMS1-208	ENST00000474147	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		3.35	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms