RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 PEX7O00628 323 aa6.39□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 GCGP01275 180 aa6.39□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 SMUG1Q53HV7 270 aa6.39□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.39□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.39□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 SFT2D1Q8WV19 159 aa6.39□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.39□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 SPXQ9BT56 116 aa6.39□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.38□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.38□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 H3BNG1 76 aa6.38□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 M0R2N4 97 aa6.38□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 IGHV3-53P01767 116 aa6.38□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 TYMSP04818 313 aa6.38□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 PPT1P50897 306 aa6.38□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 CCL18P55774 89 aa6.38□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 CST9LP1Q5W188 147 aa6.38□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.38□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 RASL10AQ92737 203 aa6.38□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 KCNS1Q96KK3 526 aa6.38□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 SDF2L1Q9HCN8 221 aa6.38□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.38□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.38□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.37□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.37□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 A0A1B0GV50 99 aa6.37□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 PAGE4O60829 102 aa6.37□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 C1QBP02746 253 aa6.37□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.37□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 ZFP69Q49AA0 526 aa6.37□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.37□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.37□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.36□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 M0R2P5 195 aa6.36□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 SLAQ13239 276 aa6.36□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 FHL2Q14192 279 aa6.36□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.36□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.36□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.36□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 A0A096LPF7 62 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 PAX4O43316 350 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 SFTA3P0C7M3 94 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 CRIP1P50238 77 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 RAB5CP51148 216 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 CRYBA4P53673 196 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 UBE2G1P62253 170 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 ESRGQ1W209 222 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 Q6ZR54 194 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 Q86TA4 180 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 AKAP14Q86UN6 197 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 SLC51BQ86UW2 128 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 FMC1Q96HJ9 113 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 ZNF479Q96JC4 524 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 PRO0255Q9UI72 69 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.35□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.34□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.34□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 C9JCJ5 164 aa6.34□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 SULT1A2P50226 295 aa6.34□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 CCL20P78556 96 aa6.34□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 ZNF876PQ49A33 203 aa6.34□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.34□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.34□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.34□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.34□□□□□ -1.39
SYN3-211ENST00000472027 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.33□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.33□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 PGPEP1LA6NFU8 196 aa6.33□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 LTAP01374 205 aa6.33□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 ORM1P02763 201 aa6.33□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 AKR1C3P42330 323 aa6.33□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 C9orf85Q96MD7 179 aa6.33□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 Q9H8V8 135 aa6.33□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.33□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.32□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 B4DEV8 164 aa6.32□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 KRBOX1C9JBD0 128 aa6.32□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 TEX46H3BTG2 121 aa6.32□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 RTL8CO15255 209 aa6.32□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 SH2D1AO60880 128 aa6.32□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.32□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.32□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.32□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 PTH2Q96A98 100 aa6.32□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 UPK3BQ9BT76 320 aa6.32□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 GNG13Q9P2W3 67 aa6.32□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 DNAH2Q9P225 4427 aa6.31□□□□□ -1.4
SYN3-211ENST00000472027 A0A1B0GVG6 124 aa6.31□□□□□ -1.4
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