RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 DPM3Q9P2X0 92 aa10.4□□□□□ -0.74
SH3BP1-206ENST00000469947 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 H3BVH4 76 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 PLNP26678 52 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 C8orf86Q6ZUL3 223 aa10.39□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 ARL17AQ8IVW1 177 aa10.39□□□□□ -0.75
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SH3BP1-206ENST00000469947 SCGB3A1Q96QR1 104 aa10.38□□□□□ -0.75
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SH3BP1-206ENST00000469947 MT-ATP8P03928 68 aa10.37□□□□□ -0.75
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SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM78Q5T7P6 136 aa10.37□□□□□ -0.75
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SH3BP1-206ENST00000469947 PRADC1Q9BSG0 188 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 RAXQ9Y2V3 346 aa10.37□□□□□ -0.75
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SH3BP1-206ENST00000469947 SCGB1D4Q6XE38 83 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 NPBQ8NG41 125 aa10.37□□□□□ -0.75
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SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF815PA8K554 130 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 ECSCRQ19T08 205 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 IGFL3Q6UXB1 125 aa10.36□□□□□ -0.75
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SH3BP1-206ENST00000469947 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
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SH3BP1-206ENST00000469947 C15orf32Q32M92 178 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 HIF1ANQ9NWT6 349 aa10.36□□□□□ -0.75
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SH3BP1-206ENST00000469947 BUB3O43684 328 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 DEFB1P60022 68 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 TSPAN13O95857 204 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP1-206ENST00000469947 XGP55808 180 aa10.34□□□□□ -0.75
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SH3BP1-206ENST00000469947 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa10.34□□□□□ -0.75
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SH3BP1-206ENST00000469947 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.33□□□□□ -0.76
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SH3BP1-206ENST00000469947 BAALCQ8WXS3 180 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 RASL10AQ92737 203 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 UBE2D3P61077 147 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 UBE2D2P62837 147 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 CARD19Q96LW7 228 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 CLPSL1A2RUU4 121 aa10.32□□□□□ -0.76
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SH3BP1-206ENST00000469947 CD3EP07766 207 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 GATA3P23771 443 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 C2orf66Q6UXQ4 117 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 OR11H6Q8NGC7 330 aa10.32□□□□□ -0.76
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SH3BP1-206ENST00000469947 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 TOMM6Q96B49 74 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 KIR2DL4Q99706 377 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 GRNP28799 593 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 G3V318 75 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 SCGB2A1O75556 95 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 ERG28Q9UKR5 140 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 ZFHX3Q15911 3703 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 COX6B1P14854 86 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 LY6G5BQ8NDX9 201 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP1-206ENST00000469947 PPDPFLQ8WWR9 84 aa10.3□□□□□ -0.76
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